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Quel test utiliser?
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Quel test utiliser?
Bonjour,
Je me présente je m'appelle Thomas et je suis actuellement en deuxième année de Master de Neurosciences,
N'étant pas un grand professionnel de statistiques je me permet d'écrire ce post pour avoir un petit coup de pouce,
J'aimerais en effet comparer deux populations indépendantes (A et B) pour lesquelles je collecte quotidiennement une donnée qualitative ordinale : (concrètement un score qui va de 0 à 4), pour la population A j'ai pour la plupart des jours un n = 16 individus avec t = 19 jours pour la durée de l'expérience. Pour la population B, on a un n = 12 individus avec t = 20 jours pour la durée de l'expérience. Il est important de noter que le n est variable au cours de l'expérience : i.e il n'y a pas de data pour certains jours pour certains individus.
J'aimerais savoir s'il y a une différence entre ces deux populations au cours du temps (Si le groupe A a un score qui globalement s'améliore au cours du temps par rapport au groupe B par exemple), ne supposant pas que les populations suivent une distribution normale je me suis tourné vers un test non paramétrique de Kruskal-Wallis, est ce selon vous le bon test?
Si oui, comment puis-je prendre en compte le fait qu'il manque de la data pour certains timepoints, dois-je moyenner le score des individus pour chaque jours au sein de chaque groupe et comparer le score moyen?
Cordialement,
Thomas
Je me présente je m'appelle Thomas et je suis actuellement en deuxième année de Master de Neurosciences,
N'étant pas un grand professionnel de statistiques je me permet d'écrire ce post pour avoir un petit coup de pouce,
J'aimerais en effet comparer deux populations indépendantes (A et B) pour lesquelles je collecte quotidiennement une donnée qualitative ordinale : (concrètement un score qui va de 0 à 4), pour la population A j'ai pour la plupart des jours un n = 16 individus avec t = 19 jours pour la durée de l'expérience. Pour la population B, on a un n = 12 individus avec t = 20 jours pour la durée de l'expérience. Il est important de noter que le n est variable au cours de l'expérience : i.e il n'y a pas de data pour certains jours pour certains individus.
J'aimerais savoir s'il y a une différence entre ces deux populations au cours du temps (Si le groupe A a un score qui globalement s'améliore au cours du temps par rapport au groupe B par exemple), ne supposant pas que les populations suivent une distribution normale je me suis tourné vers un test non paramétrique de Kruskal-Wallis, est ce selon vous le bon test?
Si oui, comment puis-je prendre en compte le fait qu'il manque de la data pour certains timepoints, dois-je moyenner le score des individus pour chaque jours au sein de chaque groupe et comparer le score moyen?
Cordialement,
Thomas
Tomtop- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 10/04/2017
Re: Quel test utiliser?
Si, j'ai bien compris, non. Il faut que les données suivent une loi normale, et si non on peut partir sur du non-paramétrique. Ca oui. Mais il faut également que les données soient indépendantes, or j'ai cru comprendre dans votre explication - mais n'en suis pas sûr - que ce sont les mêmes individus qui sont suivis au cours du temps. Est-ce le cas ? Si ce sont des individus différents à chaque fois, alors un test de Krusal-Wallis (ou un test de Wilcoxon, ce qui est équivalent puisque vous n'avez que deux groupes) fera l'affaire. Si non, les choses se compliquent sensiblement..Tomtop a écrit:J'aimerais savoir s'il y a une différence entre ces deux populations au cours du temps (Si le groupe A a un score qui globalement s'améliore au cours du temps par rapport au groupe B par exemple), ne supposant pas que les populations suivent une distribution normale je me suis tourné vers un test non paramétrique de Kruskal-Wallis, est ce selon vous le bon test?
HTH, Eric.
Eric Wajnberg- Nombre de messages : 1238
Date d'inscription : 14/09/2012
Re: Quel test utiliser?
Bonjour, merci pour cette réponse rapide!
On suit les mêmes individus pendant la durée t auxquels on attribut le score en questions, (dans chaque groupe on a n individus). Mais entre les deux groupes A et B il s'agit bien d'individus différents, un groupe contrôle, et un groupe expérimental
On suit les mêmes individus pendant la durée t auxquels on attribut le score en questions, (dans chaque groupe on a n individus). Mais entre les deux groupes A et B il s'agit bien d'individus différents, un groupe contrôle, et un groupe expérimental
Tomtop- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 10/04/2017
Re: Quel test utiliser?
Vous avez alors toujours la ressource de faire des tests de Kruskal-Wallis à chaque date, mais vous perdez l'information issue de la chronique du suivi. Si vous étiez dans le cas gaussien, pour pourriez faire une ANOVA sur données répétées (ou mixte). Je n'ai pas de solution à proposer dans le cas non-paramétrique. Peut-être d'autres lecteurs de ce forum en auront. Désolé d'être pas très plus utile que cela.
Cordialement, Eric.
Cordialement, Eric.
Eric Wajnberg- Nombre de messages : 1238
Date d'inscription : 14/09/2012
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