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contrastes sur modele lineaire lme
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contrastes sur modele lineaire lme
Bonjour
Je voudrais tester un contraste entre les interations (CS:A) et (CS:B) du modele lineaire aleatoire de la forme
Indice~A + CS+CP+CS:A+CP:B
CS et Cp sont seulement des variables binaires
j'utilise pour le modele lineaire le package nlme et je vois pas comment faire pour tester mon contrastes.
quelqu'un peut il me renseigner
merci d'avance
Je voudrais tester un contraste entre les interations (CS:A) et (CS:B) du modele lineaire aleatoire de la forme
Indice~A + CS+CP+CS:A+CP:B
CS et Cp sont seulement des variables binaires
j'utilise pour le modele lineaire le package nlme et je vois pas comment faire pour tester mon contrastes.
quelqu'un peut il me renseigner
merci d'avance
fabien4944- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 18/08/2011
Re: contrastes sur modele lineaire lme
Salut,
Si j'ai bien compris : les contrastes sous R se gèrent sur les facteurs en eux-même avec la fonction contrasts().
Donc tu dois imposer ton contrasts à tes facteurs en construisant la matrice des contrastes qui t'intéresse :
un exemple
tu peux donc mettre ce que tu veux dans tes contrastes pour chaque vecteur.
Si j'ai bien compris : les contrastes sous R se gèrent sur les facteurs en eux-même avec la fonction contrasts().
Donc tu dois imposer ton contrasts à tes facteurs en construisant la matrice des contrastes qui t'intéresse :
un exemple
- Code:
> test <- rep(c("mod1","mod2"),each=10)
> test <- as.factor(test)
> contrasts(test)
mod2
mod1 0
mod2 1
> moncontrast <- matrix(c(1,0),nc=1)
> contrasts(test) <- moncontrast
> contrasts(test)
[,1]
mod1 1
mod2 0
> model.matrix(~test)
(Intercept) test1
1 1 1
2 1 1
3 1 1
4 1 1
5 1 1
6 1 1
7 1 1
8 1 1
9 1 1
10 1 1
11 1 0
12 1 0
13 1 0
14 1 0
15 1 0
16 1 0
17 1 0
18 1 0
19 1 0
20 1 0
attr(,"assign")
[1] 0 1
attr(,"contrasts")
attr(,"contrasts")$test
[,1]
mod1 1
mod2 0
tu peux donc mettre ce que tu veux dans tes contrastes pour chaque vecteur.
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
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