Modèle linéaire mixte ?

Bonjour à tous,

Après de longue recherches sur internet, je m'adresse à vous dans un dernier espoir

Je possède un jeu de données avec le suivi de concentration chez des individus au cours de leur vie. La vie est défine en trois stades (jeu de données : https://www.wetransfer.com/downloads/1a525f3e1e7925a618eeaa611f2f20bb20141008075138/46fd09665593431f5609589b5270cbdc20141008075138/bf07f1)
Je cherche à savoir si il y a une différence significative des concentrations entre chaque stade. Au départ j'avais fait un Kruskal mais on m'a fait remarqué que les données n'étaient pas indépendantes entre les stades puisque c'étaient les même individus retrouvés dans les différents stades.

Je me tourne donc vers les modèle mixte mais des doutes restent encore :
Est-ce la bonne méthode statistique ?
J'ai cru comprendre que les modèles linéaires à effet mixte, la distribution des données doit être normale, mais dois-je ici prendre toutes les données et vérifier que leur distribution est normale ou stade par stade ?
Dans le cas de données non normales, je dois prendre un modèle généralisé ?

Si quelqu'un peut m'aiguiller sur ces questions ca pourrait bien m'aider
Merci par avance
CHa

Charlottesi a écrit:
Est-ce la bonne méthode statistique ?
J'ai cru comprendre que les modèles linéaires à effet mixte, la distribution des données doit être normale, mais dois-je ici prendre toutes les données et vérifier que leur distribution est normale ou stade par stade ?
Dans le cas de données non normales, je dois prendre un modèle généralisé ?

Bonjour,

oui je pense que la méthode serait ok.
Par contre il faut vérifier qu'il n'y ai pas de corrélation entre les régresseurs et la variable mise en effet aléatoire, sinon les effets fixes seront biaisés...

Ce n'est pas la distribution des données qui doit être normale (enfin si, mais conditionnellement aux valeurs de tes régresseurs, ce que tu ne peux mesurer vraiment). C'est surtout la distribution des résidus qui doivent suivre une loi normale dans le cas d'une régression linaire.

Niaboc

Merci beaucoup pour ta réponse.
une petite question subsidiaire : Est-ce qu'il est possible d'avoir des test post hoc sur le modèle mixte ?

Si tu as un bon cours ou de la doc abordable, je suis preneuse !!

Merci encore
*
Cha

Charlottesi a écrit:Merci beaucoup pour ta réponse.
une petite question subsidiaire : Est-ce qu'il est possible d'avoir des test post hoc sur le modèle mixte ?

Si tu as un bon cours ou de la doc abordable, je suis preneuse !!

Merci encore
*
Cha

J'avais pas vraiment regarder tes données et c'est vrai que c'est une ANOVA et tu peux donc vérifier la normalité de tes données AU SEIN de chaque groupe avant de faire la régression. Même si tu peux toujours le faire sur les résidus uniquement.

Le fait de mettre ton individu en tant qu'effet aléatoire va permettre de mieux gérer la variance au sein de ton modèle et d'avoir des estimations plus précises (sur les tests de significativité de tes coefficients du modèle). Par contre il faut bien vérifier qu'il n'y a pas de corrélation entre ton facteur aléatoire (les individus dans ton cas) et le régresseur (stade) sinon il y aurait des biais dans l'estimation => je pense que vérifier que le plan est équilibré suffit du coup.

En cherchant un peu je n'ai pas trouvé de test post hoc pour le modèle mixte.

Pour ce qui est des cours, tu peux en trouver pas mal en cherchant sur google (exemple : "mixed anova" "anova mixte" "anova effet aléatoire")

http://webcom.upmf-grenoble.fr/LIP/Perso/DMuller/M2R/R_et_Mixed/diapos/ModelesMixtes.pdf
http://www.math.univ-toulouse.fr/~besse/Wikistat/pdf/st-m-modmixt6-modmixt.pdf

Bon courage Charlotte!

Niaboc

Merci beaucoup, Niaboc !