Manova

Bonjour tout le monde,
s'il vous plait aidez moi;
je voulais faire une analyse de régime alimentaire une espèce . est ce que j'utilise manova avec log(x+1) (x=abondance) ou bien un glm. j'ai deux facteur que je veux étudier, la variabilité selon la saison et la variabilité dans dans les sites.
Merci d'avance.

Bonjour,

Désolé pour la réponse tardive. La MANOVA est assez limitée (autant qu'un lm) à cause des hypothèses de base du modèle. Les abondances se distribuent généralement selon un modèle de poisson et donc de toute façon pas selon les hypothèses du lm (le lien moyenne-variance n'est pas égal à 1). En outre, il y a de forte chance que tes régimes alimentaires soient spatialement et temporellement auto-corrélés.
Personnellement, je partirais sur de l'analyse multivariée simple en commençant par des analyses intra et inter classes.
La possibilité du glm reste ouverte mais peut être plus en utilisant les proportions plutôt que l'abondance brute et en utilisant un glm à logit cumulés par exemple. Tu pourrais également utiliser les coordonnées factorielle issues d'une ACP ou d'une AFC dans un glm.

Bref, pas mal de possibilités mais par contre éviter la transformation log(x+1) qui est un non sens en termes écologiques et qui n'arrangent généralement pas plus que ça les distributions d'abondances en termes de normalité.

HTH

Nik