facteur aléatoire

Bonjour,

je travaille sur les invasions biologiques (par les plantes) et j'analyse un jeu de donné dont la structure est la suivante:

5 espèces invasives
5 espèces natives
Variable de réponse: biomasse produite

Les espèces sont toutes différentes et ont été choisies selon des critères assez précis: elles sont toutes dominantes et poussent sur le bord des rivières.

Je cherche à tester l'effet du facteur invasion (invasive vs. native) et du facteur espèce.
Pour cela j'ai réalisé une nested ANOVA (facteur espèce imbriqué dans le facteur invasion). Etant donné que les espèces n'ont pas été choisies aléatoirement, j'ai considéré ce facteur comme fixe.

Mes questions sont les suivantes:
- Peut-on considérer tous les facteurs comme fixes dans une nested ANOVA?
- Est-ce correct de considérer le facteur espèce comme fixe dans mon cas?

Merci d'avance

Bonjour,

Peut-on considérer tous les facteurs comme fixes dans une nested ANOVA?

A priori oui. Il vaudrait mieux que tu exprimes l'origine de ta question car ta présentation de ton analyse est assez bizarre pour moi.

Est-ce correct de considérer le facteur espèce comme fixe dans mon cas?

C'est plutôt à toi de répondre à cette question. En gros il faut que tu te demandes si un éventuelle effet espèces t'intéresse vraiment. Vu ce que tu indiques il vaut effectivement mieux le mettre en fixe en sachant que cela va te couter 9 ddl d'un point de vue stat. Donc il faut que tu réfléchisse aussi si tes données te permettent de faire ça.

Nik

- Peut-on considérer tous les facteurs comme fixes dans une nested ANOVA?

Je rejoins Nik, il n'y a aucune raison que tu ne puisses pas considérer tous tes facteurs comme fixe.

- Est-ce correct de considérer le facteur espèce comme fixe dans mon cas?

Bien sur puisque tu les as toi même sélectionnées ! Si tu considères que tu as fait un choix aléatoire d'espèce et que tu veux entendre ce résultat à toutes les espèces alors il te faut considérer ce facteur comme aléatoire, mais du moment que tu as sélectionné les espèces sur des critères précis alors c'est du fixe.