Comparaison multiple: FDR/FWER pour ensemble varié de tests

Bonjour,

Lorsqu'un grand nombre de tests statistiques est effectué sur un jeu de données il faut corriger les valeurs p pour tenir compte de l'inflation dans l'erreur de type 1. Plusieurs méthodes existent: Bonferroni (conservatrice), FWER, FDR etc.

Ma question est la suivante: pour les méthodes FWER et FDR, est-ce possible de les appliquer sur un ensemble de tests de type différent? Par example, si j'ai 20 t-tests et 23 tests Chi2, est-ce que je peux appliquer FWER ou FDR sur les 43 tests pour en corriger les valeurs p?

Cordialement,
M

Bonjour,

Les méthodes qui contrôlent soit le FWER (dont bonferroni fait partie) soit le FDR peuvent s'appliquer à n'importe quels types de tests. Ce qu'il te faut identifier c'est la famille des hypothèses: quels sont les tests qui correspondent aux tests de la même hypothèse. Si tes tests t et tes Chi² testent les mêmes hypothèses alors pas de soucis tu peux appliquer ces méthodes à l'ensemble de tes test, par contre si les hypothèses testées ne sont pas les mêmes alors il te faudra les prendre en compte séparément.

Après à toi de savoir aussi laquelle des 2 méthodes tu veux utiliser parce que ces deux méthodes ne contrôlent pas la même erreur de type 1. Il vaut mieux choisir a priori la méthode que tu veux employé plutôt qu'a posteriori en fonction des résultats qu'elles te donnent.

@+

Salut Droopy, par hypothèse tu entends quoi exactement ?

Par exemple est-ce que les tests sont appliqués sur des variables secondaires ce sont les mêmes types de tests, c'est bien ça ?

Ps : il faut bien que tous les tests soient du même type également c'est bien ça ? Par exemple que du paramétrique ou que du non-paramétrique.