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test comparaison multiple
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test comparaison multiple
Bonjour,
J'ai un petit problème concernant mon test statistique... enfin je me pose des questions.
J'ai réalisé une expérience avec 10 modalités répétées 3 fois. J'ai obtenu 3 valeurs pour chaque modalité que l'on appelera "efficacité1", "efficacité2" et " efficacité3". Mon objectif est de comparer chaque modalité entre elles.
Avant de réaliser quelconque test, je verifie les conditions de normalité (test Shapiro) et d'égalité des variances (Bartlett). Aucun des deux test est vérifié. Ne pouvant pas réaliser une ANOVA, j'utilise le test de KRUSKAL WALLIS afin de savoir si une des modalités présente une différence significative par rapport aux autres. Il se trouve que j'ai bien une valeur différente significativement. Par conséquent, j'aimerai savoir laquelle. Je voudrai donc réaliser un test de comparaison multiple. Voilà le propos de mon problème: quel test effectuer si je ne peux pas faire d'anova ? Puis je utiliser le test HSD de Tukey malgré l'anova qu'il faut réaliser au préalable ?
Merci d'avance de votre réponse
J'ai un petit problème concernant mon test statistique... enfin je me pose des questions.
J'ai réalisé une expérience avec 10 modalités répétées 3 fois. J'ai obtenu 3 valeurs pour chaque modalité que l'on appelera "efficacité1", "efficacité2" et " efficacité3". Mon objectif est de comparer chaque modalité entre elles.
Avant de réaliser quelconque test, je verifie les conditions de normalité (test Shapiro) et d'égalité des variances (Bartlett). Aucun des deux test est vérifié. Ne pouvant pas réaliser une ANOVA, j'utilise le test de KRUSKAL WALLIS afin de savoir si une des modalités présente une différence significative par rapport aux autres. Il se trouve que j'ai bien une valeur différente significativement. Par conséquent, j'aimerai savoir laquelle. Je voudrai donc réaliser un test de comparaison multiple. Voilà le propos de mon problème: quel test effectuer si je ne peux pas faire d'anova ? Puis je utiliser le test HSD de Tukey malgré l'anova qu'il faut réaliser au préalable ?
Merci d'avance de votre réponse
casino- Nombre de messages : 14
Date d'inscription : 14/06/2011
Re: test comparaison multiple
Salut,
Le test de Dunn est un test post hoc pour le kruskal wallis. Si tu utilises R tu peux regarder la fonction kruskalmc().
ça c'est pour la réponse directe à ta question. Pour être plus dans l'esprit stat, comparer des catégories avec seulement 3 valeurs relève de l'utopie même avec un test non paramétrique. Les stats reposent sur un N grand. De plus 10 catégories ça commence à faire beaucoup donc rien d'étonnant à ce que ton test apparaisse significatif. Le simple hasard peut expliquer cela sans qu'il y ait de réelle différence. Même si tu dois passer par les stats non paramétriques il ne faut surtout pas perdre de vue les valeurs réelle et regarder au moins graphiquement si les différences observées sont importantes ou au contraire négligeables.
nik
Le test de Dunn est un test post hoc pour le kruskal wallis. Si tu utilises R tu peux regarder la fonction kruskalmc().
ça c'est pour la réponse directe à ta question. Pour être plus dans l'esprit stat, comparer des catégories avec seulement 3 valeurs relève de l'utopie même avec un test non paramétrique. Les stats reposent sur un N grand. De plus 10 catégories ça commence à faire beaucoup donc rien d'étonnant à ce que ton test apparaisse significatif. Le simple hasard peut expliquer cela sans qu'il y ait de réelle différence. Même si tu dois passer par les stats non paramétriques il ne faut surtout pas perdre de vue les valeurs réelle et regarder au moins graphiquement si les différences observées sont importantes ou au contraire négligeables.
nik
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
Re: test comparaison multiple
Salut nik,
Merci beaucoup pour ta réponse et l'analyse de mon problème. En effet, lorsque l'on observe graphiquement les valeurs grâce à un simple plot sur R, on peut voir beaucoup plus de différence entre chaque modalité que par le test statistique. Mais est-il possible de montrer qu'elles sont significatives à travers un graphique ?
Est ce que le test de dunn est équivalent à la fonction kruskalmc() dans R ? Où y-a til une fonction spécifique pour Dunn car je ne trouve rien dans R qui y fait reference ?
Merci beaucoup pour ta réponse et l'analyse de mon problème. En effet, lorsque l'on observe graphiquement les valeurs grâce à un simple plot sur R, on peut voir beaucoup plus de différence entre chaque modalité que par le test statistique. Mais est-il possible de montrer qu'elles sont significatives à travers un graphique ?
Est ce que le test de dunn est équivalent à la fonction kruskalmc() dans R ? Où y-a til une fonction spécifique pour Dunn car je ne trouve rien dans R qui y fait reference ?
casino- Nombre de messages : 14
Date d'inscription : 14/06/2011
Re: test comparaison multiple
*Est ce que le test de dunn est équivalent à la fonction kruskalmc() dans R ? Où y-a til une fonction spécifique pour Dunn car je ne trouve rien dans R qui y fait reference ?
Je ne sais pas mais kruskalmc fera très bien l'affaire à mon avis.
Non bien sûr puisque pour parler de significativité il faut une statistique et une p-value.Mais est-il possible de montrer qu'elles sont significatives à travers un graphique ?
La vraie question esst plutôt de savoir si tes données sont réellement adaptées pour une question stat. Ma réponse personnelle serait plutôt non.
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
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