Test de Mann-Whitney ?

Bonjour à tous !

Je vous sollicite car j'aurai grandement besoin de vos connaissances en statistiques:

Je suis en stage de fin de Licence de biologie et je dois faire une analyse statisitque sous R, voici un exemple de mes données à analyser:
code  02AM  02AIK
111 0.11  NA
112 2.72  1.2772
121 0.08  NA
122 0.03  NA
124 0.00  NA
131 0.70  0.0000
132 0.00  NA
133 0.00  NA
142 0.07  0.0000
211 4.11  3.6075
221 15.14  20.6253
222 1.60  0.4490
231 10.21  17.1918
242 31.67  35.8941
243 1.50  0.9281
311 17.52  12.4948
312 2.14  0.0997
313 10.57  7.4326
321 0.00  0.0000
322 0.00  0.0000
324 0.29  0.0000
412 0.00  NA
511 1.39  0.0000
512 0.14  0.0000


En fait je dois comparer la part des biotopes que coupent des circuits d'observation de la faune avec la part des biotopes retrouvés sur différentes zones.


Les codes 111, 112, 121 représentent différents biotopes
02AM correspond à la 1er zone étudiée et 02AIK au premier circuit.

C'est pourquoi, n'ayant jamais travaillé sur des tests non paramétriques, j'aurai besoin de votre aide:

Je pensais utiliser le test de Mann-Whitney, ai-je raison ?

En vous remerciant d'avance pour vos conseils,

Romain.

ou il faut peut être plutôt utiliser un test de wilcoxon puisque je viens de voir en faisant des recherches sur internet que visiblement mann et withney est plutot destiné à voir si 2 échantillons indépendants sont issus d'une meme population, chose qui ne concerne pas mon problème ici. :/

Quelqu'un aurait une idée ? Même un avis rapide m'aiderait peut être beaucoup ! ^^

Bonjour,

Utilise la fonction éditer pour ton message.
En plus tu poses ta question un dimanche pendant que les vacances ont certainement commencé. Bref les gens ne sont pas fixés sur ce forum.

Désolé d'être un peu sec mais bon ...

Bonjour Romain, si je comprends bien, tu veux comparer deux variables numériques ?

Le test de Pairwise Mann-Whitney n'est applicable que pour croiser une variable numérique avec une variable catégorielle il me semble.

Désolé pour la fonction "éditer", je n' avais pas pensé !

Zezima: oui je veux comparer deux variables numériques,

En fait j'ai construit des circuits à IKA (indice kilométrique d'abondance) sur un logiciel de SIG en ayant comme support la carte biogéographique de la Dordogne. Mes circuit passent donc par plusieurs biotopes tels que des champs cultivés, des plaines, des fôrets (pour simplifier), et je veux donc vérifier si il y a des différences significatives entre ces circuits et les différent massifs où passent ces derniers en termes de biotopes.

Par exemple:
Le massif 02AM est composé de 0.11% du biotope 111, de 2.72% du biotope 112 etc...
Le circuit 02AIK lui est composé de 1.27% du biotope 112 etc...

Je ne sais pas si c'est plus clair ? ^^

En tout cas je te remercie vraiment de t'être penché sur mon problème !

Oui c'est plutôt clair, tu veux comparer deux listes de variables numérique et savoir si elles suivent la même distribution ?

Personnellement, je ne maitrise pas du tout les régressions linéaires.
Droopy ou FMarwen pourront plus t'aider.

En tout cas, il n'existe pas de test entre deux variables numériques à ma connaissance.

Voilà c'est ça !

Ok merci beaucoup d'avoir pris le temps de me répondre en tout cas !

zezima a écrit:
En tout cas, il n'existe pas de test entre deux variables numériques à ma connaissance.

????????????????????????????
Et la régression, la corrélation? Et j'en passe...


Mais pour en revenir à la question initiale, il n'y a pas de statistique à faire dans ce cas car on ne fait pas de stats pour comparer des échantillons de taille 1!!!

Ayana

Oui j'ai cité la régression (dont j'ai très peu de connaissances) mais je ne savais pas qu'on appelait ça un test, c'est pour ça que j'ai répondu avec des pincettes.

J'essayais juste de l'informer, il insistait, c'était plus fort que moi !

Maintenant je me tais  

Ah non, le but c'est que tout le monde parle! On ne brime personne!!
Mais on serait bien avancés si on n'avait rien pour analyser les données numériques. Et puis même, je considère les tests type Mann et Whitney et Student comme des tests comparant des distributions numériques, même si ce sont des groupes définis par les modalités d'une variable qualitative.

Oui exactement, en tout cas grâce à ta réponse je vais pouvoir avancer dans mes analyses (j'avais laissé de côté les croisements entre variables numériques). La toute simple corrélation m'était complètement sortie de l'esprit.

Merci

Bonjour Ayana et merci de tes réponses !

Mais lorsque tu dis "il n'y a pas de statistique à faire dans ce cas car on ne fait pas de stats pour comparer des échantillons de taille 1!!!" je ne comprends pas très bien pourquoi je ne pourrai pas faire un test statistique sur mon jeu de données étant donné que j'ai bien 2 échantillons distincts et une vingtaine de valeurs ? :S

Il doit bien avoir un moyen de montrer si il existe des différences significatives entre mes deux échantillons non ?

Les tests statistiques sont faits pour faire des inférences à partir d'un échantillon sur une population générale. Un échantillon est un groupe d'individus ou de n'importe quel type d'unité supposé représentatif de la population. Pour pouvoir faire des statistiques, chaque échantillon doit être suffisamment grand . Or dans ton exemple tu n'as que deux circuits que tu cherches à comparer (même si tu as plein d'infos pour chaque). Tu ne peux que les décrire, la statistique ne peut rien faire dans ces cas là.

Ayana

C'est vrai que l'exposé de ta question/hypothèse est loin d'être clair donc il est possible qu'on réponde à côté...

Justement ce n'est pas deux circuits que je cherche à comparer mais plutôt une zone géographique et un circuit issue de cette même zone, je pensais donc que je pouvais comparer mon échantillon "circuit" à ma zone qui pourrait représentée en quelque sorte ma population de référence (c'est sûrement mal dit et un peu tiré par les cheveux.. :S)

tu voudrais comparer le pourcentage de biotopes fréquentés pendant le circuit par rapport aux biotopes disponible. Faire une sorte d'évaluation de l'habitat utilisé au cours du circuit ?

Dans ce cas tu n'as qu'une seule mesure. Si c'est pas ça eh bien je ne comprends toujours pas ce que sont les chiffres dans tes colonnes et ce que tu souhaites en faire.

Nik

"tu voudrais comparer le pourcentage de biotopes fréquentés pendant le circuit par rapport aux biotopes disponible"

Oui en gros c'est ça Nik !
Du coup quel test pourrais je utiliser pour effectuer ce test ?

Du coup quel test pourrais je utiliser pour effectuer ce test ?

je crains de ne pas avoir été clair...si c'est ça que tu veux faire, tu n'as qu'une seule valeur et donc je rejoins l'avis d'Ayana, tu ne peux rien faire en stat sur cette question.

Tu aurais dû avoir des réplicats de circuits pour pouvoir conclure. Si tu nous dis ce que sont les valeurs dans ton tableau alors peut être qu'on pourra avoir d'autres idées sur ce que tu peux faire mais à priori c'est assez mal engagé.

Nik

Mince ! :/

Bon c'est pas grave je vais essayer de me débrouiller autrement du coup.

Merci pour tes réponses en tout cas Nik !

Bonne semaine à tous