faire une AFC ou une ACP ?

Bonjour,

J'ai a analyser des données de comptages d'oiseaux : 21 sites * 10 comptages *5 ans, soit 1000 relevés environ, et 25 espèces.
J'ai donc un tableau de contingence espèces/relevés, auquel j'ai appliqué log (effectif +1) pour minimiser les différences d'effectifs (variant entre 0 et 1000). Est il posible de faire une AFC sur ce tableau, ou est ce que du fait du log il est nécessaire de faire une ACP ?

Merci pour vos réponses, j'avoue que je suis un peu perdue...

Premièrement je commencerai par faire l'afc sans la transformation en log pour effectivement voir si tu as des correspondances pointues. Si ce n'est pas le cas je garderai mon analyse tel quel. Sinon une fois que les données sont transformées en log tu peux aussi bien faire une ACP qu'une AFC, ce qui change dans ces deux analyses c'est leur point de vue. Dans le cas d'une ACP tu vas essayé de caractériser tes lignes par tes colonnes, alors que l'AFC est une analyse symétrique : tu as les mêmes résultats quelque soit le sens de ta matrice. De plus avec une AFC tu vas travailler sur les fréquences relatives du nombre de taxa dans un site par rapport à la fréquence de ce taxa dans le tableau et la fréquence de cette ligne dans le tableau. Alors que dans l'ACP tu vas travailler sur le gradient d'individus pour tes taxas, autrement dit tu vas regarder quels sont les taxas qui varient ensemble.

Après tout dépend ce que tu cherches à faire mais moi je partirai sur l'AFC mais c'est plus une question de phylosophie et d'expérience.

L'AFC étant plutôt faite au départ pour étudier une table de contingence.

micros