comparaison de moyenne

Bonjour,

je suis étudiante en MASTER 2 en écologie. je ne sais pas si je dois utiliser une anova ou un KI2

Voici l'énoncé:

je vais réaliser 5 relevés de végétation dans des carrés de 10m/10m sur une ligne. Je vais donc avoir 5 réplicats sur 1 ligne et je vais le faire sur 5 lignes.....
Aussi, pour chaque relevé dans un carré de 10m/10 je cherche 15 espèces végétales particulière, je vais donc calculer leur fréquence dans chaque carré et avoir pour chaque carré 5 réplicats avec à l'intérieur 15 fréquences multiplier par le nombre de ligne qui est de 5.

quels tests statistique me conseilleriez vous ?

je vous en remercie par avance

marion

Si je comprend bien:
1 carré = 10m*10m
5 carrés par lignes
5 lignes en tout

Pour chaque carré, tu cherches 15 especes, et tu relèves leur fréquence c'est ça?

Mais pour répondre à ta question, pas de test sans question...
Donc qu'elle est ta problématique?

la question est de savoir quels corridors (les lignes) possède le plus d'espèce indicatrice

oui je relève leurs fréquence donc j'aurai pour chaque carré, la fréquence de mes 15 especes

Le plus d'espèces indicatrices toutes espèces confondues, ou le plus d'individus par espèce?

j'ai 15 espèces indicatrices déterminés. je compte le nombre d'individu de ces chaque espèces.

Je reformule...
Le but de ton analyse est de voir dans quelle ligne possède le plus d'indicatrice, mais ça peut vouloir dire différentes choses:

Tu cherches la ligne qui a le plus grand nombre d'espèces différentes?
ou
Tu cherches la ligne qui a le plus de sujets, toutes espèces confondues?
ou
Tu cherches à voir si d'une ligne à une autre le nombre de sujets par espèces varie, espèce par espèce?

la réponse 3

(D, la réponse D...)

Dans ce cas, je te conseille de faire une ANOVA, qui pourra te dire si d'une ligne à l'autre, le nombre de sujet par espèce varie. Tu as cependant 15 ANOVA à faire étant donné que tu as 15 espèces, ça te permet déjà de voir pour quelles espèces il y a une variation significative du nombre d'individus d'une ligne à l'autre.

ok et ensuite je fais un test à posteriori pour faire une comparaison entre les corridors?

Corridor = carré de 10*10?
Tu peux en effet voir si au sein d'une ligne il y a une différence entre les carrés, mais dans la mesure où tu n'as pas de répétition, je pense que de simple comparaison d'effectifs suffiront... Tu ne peux en effet pas faire d'ANOVA sur les carrés

un corridor est la ligne ou je vais faire 5 carré de 10/10.

et c'est entre mes lignes que je veux faire des comparaisons..... c'est possible ?

merci de prendre du temps pour me répondre

Tu veux voir si il y a une différence entre les différentes lignes, en fonction des espèces.
Du coup tu fais une ANOVA: effectif_especes ~ ligne
Comme ça tu peux comparer tes différentes lignes.

Est-ce que cela répond à ta question?

Je ne comprends pas ce que tu veux dire par "comparaison a posteriori" entre les lignes...

salut,

ton plan d'expérience correspond en fait à une ANOVA en mesure répétée ou à un modèle mixte.
l'effet qui t'intéresse est la différence inter-ligne (j'appelle ça des transects pour ma part ) mais la différence entre réplicats d'une même ligne ne t'intéresse pas et même idéalement il ne devrait quasiment pas y en avoir à l'erreur d'échantillonnage près.

Tu ne peux pas faire directement une ANOVA si tu supposes une structure différentes entre tes corridors.

Pour le test à posteriori type tukey HSD par exemple, je ne suis pas un fan de ces procédures mais bon si tu as absolument besoin de mettre une p-value sur quelque chose...n'oublies cependant pas que c'est l'importance de la différence qui compte et pas le côté significatif ou non qui ne veut en fait pas dire grand chose en terme pratique.

Nik

@ Nik: pourquoi l'ANOVA n'est pas conseillée si elle a pour but de justement mettre en évidence les différences de structure entre les corridors?

oulala...je crois que je vais prendre 15 jours de congès moi...
oublie mon message je suis complètement dans les choux sur ce coup. .


Ok pour l'anova mais par contre avec 5 valeurs par transects....c'est très faible. L'ANOVA risque de ne pas tenir la route.

Une possibilité si tu a recherché systématiquement 15 espèces, tu peux considérer que tu as fait 15 réplicats d'une variable binaire. Donc ton plan devient :

-5 transects
-5 quadrats par transects
-15 valeurs (0 ou 1) par quadrat

(cette fois ci c'est bien de la mesure répétées mais on est dans le cadre du modèle mixte binomial)

Nik

merci pour vos réponses

si je reviens sur ce que tu as dis Hadrien : je peux faire une anova pour comparer mes lignes si je fais une ANOVA: effectif_especes ~ ligne .
donc un tableau avec les effectifs de mes espèces par rapport à mes lignes ? c'est ça ?

merci

Voila, tu auras 5lignes*5carrés = 25 lignes,
15colonnes qui correspondent à tes effectifs pour les 15 especes, plus un identifiant de ligne.
Ensuite du fait une ANOVA de chaque colonne espece en fonction de la colonne ligne.

ok je te remercie pour ces conseils !!
bonne journée