Help, question concernant l'AFC!

Bonjour,
Je suis stagiaire en biologie végétale et je dois traiter un tableau de données de la forme suivante : en ligne, des échantillons, appartenant à une espèce parmi 6, et en colonnes, des composés chimiques. Chacun de ses composés chimiques peut être absent ou présent. Un de mes professeur m'a conseillé de réalisé une AFC. Cela m'étonne car il me semblait que une AFC visait à étudier le lien entre deux variables, X et Y, or j'ai un nombre bien plus important de variables (la variable X, correspondant à l'espèce, prenant 6 modalités, et les variables Y1,...,Yn, correspondant aux composés chimiques, prenant chacunes 2 modalités, 0 càd absence et 1 càd présence). N'est-ce pas problématique?
Merci d'avance, toutes les informations ou les conseils que vous pourrez me donner seront les bienvenus, je n'ai malheureusement que très peu de connaissances en analyses multivariées et mon stage finit bientôt..!
Nina

Bonjour,

La questin est complexe car il t'est en effet possible, d'un point de vus strictement technique, de lancer une AFC sur ce tableau.
Cependant, les calcauls de l'AFC, comme tu le précise, sont fait pour traiter un tableau de contingence (type tableau d'effectif croisé) et non pas un tableau disjonctif (type présence/absence).

Plutôt que de faire une AFC, le mieux ici serait de faire une ACM (Analyse des Correspondances Multiples).

Cependant, à réfléchir, ne serait-il pas mieux de fournir ici les quantités de composés chimiques plutôt qu'une vulgaristation présence/absence? (qui peut bien sur te donner des résultats intéressants par ailleurs).

Bien cordialement