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comparaison de proportions, bon test?

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comparaison de proportions, bon test?

Message par Boub le Mar 3 Avr 2012 - 7:41

Bonjour à tous,

Contexte: je souhaite étudier pour une maladie donnée, la localisation des tumeurs. 4 localisations sont connues: AAA, IAS, CAS, COS.

Certaines personnes ont souvent des tumeurs à 2 localisations différentes. Je souhaiterai savoir quelle est la combinaison de localisation qui ressort la plus souvent; dans le tableau ci-dessous, les effectifs des patients ayant des tumeurs localisées:
J'ai (Ce n'est pas très simple à expliquer car je n'arrive pas à créer de tableau sur mon post):
21 patients avec une tumeur AAA
12 au niveau IAS
21 au niveau CAS
12 au niveau COS

Ce que j'ai fait, c'est donc reprendre pour chaque combinaison, le nombre de patient concerné:
1: AAA/IAS = 1 patient
2: AAA/CAS = 10
3: AAA/COS = 3
4: IAS/CAS = 3
5: IAS/COS = 2
6: CAS/COS = 4

Du coup, j'aimerai comparer les 6 proportions (les 6 localisations) pour montrer statistiquement laquelle ressort le plus souvent (a priori, la n°2)...je pense que c'est une comparaison de plusieurs proportions chi-2 mais n'en suis pas sur. Je travaille sous r, et j'ai utilisé la commande prop.test et ensuite ai fait une comparaison 2 à 2 (pairwise.prop.test)....mais ne suis pas du tout sûr des résultats.

Pas simple à expliquer, n'hésiter pas à me demander des compléments si ce n'est pas clair et merci pour vos avis!
Boub

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Re: comparaison de proportions, bon test?

Message par joyeux_lapin13 le Lun 9 Avr 2012 - 19:55

Personnellement, je ferais la table de fréquence que tu présentens et j'appliquerais dessus un test exact de Fisher (le chi2 ne passera pas avec tes effectifs) puis je ferais un histogramme pour argumenter quel groupe rend mon test significatif à 5%.

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