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Message par thekeoch le Lun 3 Aoû - 19:01

Bonjour
L'objet de mon étude et de vérifier la reproductibilité de mes mesures
et s'il y a un effet de latéralité des ces mesures entre la jambe
droite et la gauche.

Au début je souhaité faire un bland et altman pour la
reproductibilité entre mon test1 et mon test2 de la jambe droite et de
même pour la jambe gauche. et Ensuite vérifier la latéralité en
effectuant un test t apparié entre la jambe droite et la jambe gauche.

Mais il y a quelques minutes on m'a suggéré de réaliser une ANOVA
à une voie à mesure répétée pour à la fois s'assurer de la
reproductibilité, des interactions éventuelles et parce que cette analyse permet de comparer en même temps mes 4 series de mesure (HbO2 dt1, HbO2 dt2, HbO2 g1 et HbO2 g2 par exemple).

Je suis un peu perdu!!!

un lien rapidshare rapidshare.com Classeur1.xls.html pour telecharger un doc excel avec un des paramètre que je mesure:
test-retest a droite et à gauche: mon objectif étant d'evaluer la reproductibilité (droite1/droite2 et gauche1/gauche2)
et la latéralité (difference ou pas droite gauche)

Merci d'avance pour votre aide.

thekeoch

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Message par Eric Pagot le Mar 4 Aoû - 8:57

D'après la structure des données, je mettrais un facteur latéralité (droite-gauche) et deux variables (la variable répétée). Le test serait une ANOVA répétée avec un facteur. Rapidement, j'ai trouvé p=0.063 pour le facteur latéralité, 0.858 pour le facteur répétition et 0.656 pour l'interaction répétition*latéralité
Effects coding used for categorical variables in model.The categorical values encountered during processing are
VariablesLevels
COTE$ (2 levels)DroiteGauche
N of Cases Processed : 28
Dependent Variable Means
O2 HB Yb 1O2 HB Yb 2
100,00899,983
Latéralité:Droite
N of Cases:14
Least Squares Means
O2 HB Yb 1O2 HB Yb 2
LS Mean99,88299,797
Standard Error0,1450,156
Latéralité:Gauche
N of Cases:14
Least Squares Means
O2 HB Yb 1O2 HB Yb 2
LS Mean100,134100,168
Standard Error0,1450,156
Univariate Repeated Measures Analysis
Between Subjects
SourceSSdfMean SquaresF-ratiop-value
Latéralité1,36111,3613,7800,063
Error9,360260,360
Within Subjects
SourceSSdfMean SquaresF-ratiop-valueG-GH-F
REPETITION0,00910,0090,0330,858..
REPETITION*Latéralité0,04910,0490,1780,676..
Error7,153260,275
Greenhouse-Geisser Epsilon.
Huynh-Feldt Epsilon.

Eric Pagot

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Message par thekeoch le Mar 4 Aoû - 11:22

Merci Eric pour ton aide
J'utilise le logiciel statview, qui necessite une certaine organisation pour les données. Si je t'ai bien compris je dois réalisé une anova à mesures repetées à deux voies facteur 1 ==> test/retest facteur 2 ==> côté.
Je te joins un doc excel te montrant l'organisation de mes données: rapidshare.com Classeur3.xls.html

Ci dessous le compte rendu de l'analyse réalisée avec cette série de donnée (mes résultats semblent différents des tiens.....)


Two Way Repeated Measures ANOVA (Two Factor Repetition) Tuesday, August 04, 2009, 1:58:40 PM



Data source: Data 1 in Notebook 1



Balanced Design



Dependent Variable: Col 5



Normality Test: Failed (P < 0.050)



Equal Variance Test: Passed (P = 1.000)



Source of Variation DF SS MS F P

Sujet 13 5.452 0.419

Côté 1 1.361 1.361 4.526 0.053

Côté x Sujet 13 3.908 0.301

test 1 0.00903 0.00903 0.0312 0.862

test x Sujet 13 3.762 0.289

Côté x test 1 0.0490 0.0490 0.188 0.672

Residual 13 3.391 0.261

Total 55 17.932 0.326





The difference in the mean values among the different levels of Côté is not great enough to exclude the possibility that the difference is just due to random sampling variability after allowing for the effects of differences in test. There is not a statistically significant difference (P = 0.053).



The difference in the mean values among the different levels of test is not great enough to exclude the possibility that the difference is just due to random sampling variability after allowing for the effects of differences in Côté. There is not a statistically significant difference (P = 0.862).



The effect of different levels of Côté does not depend on what level of test is present. There is not a statistically significant interaction between Côté and test. (P = 0.672)



Power of performed test with alpha = 0.0500: for Côté : 0.402

Power of performed test with alpha = 0.0500: for test : 0.0500

Power of performed test with alpha = 0.0500: for Côté x test : 0.0500



Least square means for Côté :

Group Mean

G 100.151

D 99.839

Std Err of LS Mean = 0.104



Least square means for test :

Group Mean

x 100.008

w 99.983

Std Err of LS Mean = 0.102



Least square means for Côté x test :

Group Mean

G x x 100.134

G x w 100.168

D x x 99.882

D x w 99.797

Std Err of LS Mean = 0.136

Merci d'avance


Dernière édition par thekeoch le Mar 4 Aoû - 12:04, édité 1 fois

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Message par Eric Pagot le Mar 4 Aoû - 12:01

Je ne connaîs pas le logiciel statview, j'utilise systat. S'il est possible de mettre facteur1 en donnée répétée pour l'analyse, la présentation est effectivement celle-ci. Sous systat il faut faire 2 variables : une pour la première mesure, une pour la deuxième et spécifier dans le test que les deux variables sont répétées...

Eric Pagot

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Message par thekeoch le Mar 4 Aoû - 12:10

Je ne connais pas bien ce logiciel (statview). Simplement en choississant les test que tu veux réaliser l'interface de demande de sélectionner dans l'exemple qui nous interresse d'abord la colonne sujet, puis la colonne du facteur 1 puis celle du facteur 2 et enfin la colonne données.

- Quest que tu appelles "variables"

Ci dessous le compte rendu de l'analyse réalisée avec cette série de donnée (mes résultats semblent différents des tiens.....)


Two Way Repeated Measures ANOVA (Two Factor Repetition) Tuesday, August 04, 2009, 1:58:40 PM



Data source: Data 1 in Notebook 1



Balanced Design



Dependent Variable: Col 5



Normality Test: Failed (P < 0.050)



Equal Variance Test: Passed (P = 1.000)



Source of Variation DF SS MS F P

Sujet 13 5.452 0.419

Côté 1 1.361 1.361 4.526 0.053

Côté x Sujet 13 3.908 0.301

test 1 0.00903 0.00903 0.0312 0.862

test x Sujet 13 3.762 0.289

Côté x test 1 0.0490 0.0490 0.188 0.672

Residual 13 3.391 0.261

Total 55 17.932 0.326





The difference in the mean values among the different levels of Côté is not great enough to exclude the possibility that the difference is just due to random sampling variability after allowing for the effects of differences in test. There is not a statistically significant difference (P = 0.053).



The difference in the mean values among the different levels of test is not great enough to exclude the possibility that the difference is just due to random sampling variability after allowing for the effects of differences in Côté. There is not a statistically significant difference (P = 0.862).



The effect of different levels of Côté does not depend on what level of test is present. There is not a statistically significant interaction between Côté and test. (P = 0.672)



Power of performed test with alpha = 0.0500: for Côté : 0.402

Power of performed test with alpha = 0.0500: for test : 0.0500

Power of performed test with alpha = 0.0500: for Côté x test : 0.0500



Least square means for Côté :

Group Mean

G 100.151

D 99.839

Std Err of LS Mean = 0.104



Least square means for test :

Group Mean

x 100.008

w 99.983

Std Err of LS Mean = 0.102



Least square means for Côté x test :

Group Mean

G x x 100.134

G x w 100.168

D x x 99.882

D x w 99.797

Std Err of LS Mean = 0.136


Merci d'avance

thekeoch

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Message par thekeoch le Mar 4 Aoû - 18:08

thekeoch a écrit:Je ne connais pas bien ce logiciel (statview). Simplement en choississant les test que tu veux réaliser l'interface de demande de sélectionner dans l'exemple qui nous interresse d'abord la colonne sujet, puis la colonne du facteur 1 puis celle du facteur 2 et enfin la colonne données.

- Quest que tu appelles "variables"

- peut tu m'envoyer ton fichier systat pour que je vois comment tu organise tes variables?

Ci dessous le compte rendu de l'analyse réalisée avec cette série de donnée (mes résultats semblent différents des tiens.....)


Two Way Repeated Measures ANOVA (Two Factor Repetition) Tuesday, August 04, 2009, 1:58:40 PM



Data source: Data 1 in Notebook 1



Balanced Design



Dependent Variable: Col 5



Normality Test: Failed (P < 0.050)



Equal Variance Test: Passed (P = 1.000)



Source of Variation DF SS MS F P

Sujet 13 5.452 0.419

Côté 1 1.361 1.361 4.526 0.053

Côté x Sujet 13 3.908 0.301

test 1 0.00903 0.00903 0.0312 0.862

test x Sujet 13 3.762 0.289

Côté x test 1 0.0490 0.0490 0.188 0.672

Residual 13 3.391 0.261

Total 55 17.932 0.326





The difference in the mean values among the different levels of Côté is not great enough to exclude the possibility that the difference is just due to random sampling variability after allowing for the effects of differences in test. There is not a statistically significant difference (P = 0.053).



The difference in the mean values among the different levels of test is not great enough to exclude the possibility that the difference is just due to random sampling variability after allowing for the effects of differences in Côté. There is not a statistically significant difference (P = 0.862).



The effect of different levels of Côté does not depend on what level of test is present. There is not a statistically significant interaction between Côté and test. (P = 0.672)



Power of performed test with alpha = 0.0500: for Côté : 0.402

Power of performed test with alpha = 0.0500: for test : 0.0500

Power of performed test with alpha = 0.0500: for Côté x test : 0.0500



Least square means for Côté :

Group Mean

G 100.151

D 99.839

Std Err of LS Mean = 0.104



Least square means for test :

Group Mean

x 100.008

w 99.983

Std Err of LS Mean = 0.102



Least square means for Côté x test :

Group Mean

G x x 100.134

G x w 100.168

D x x 99.882

D x w 99.797

Std Err of LS Mean = 0.136


Merci d'avance

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Message par Eric Pagot le Mer 5 Aoû - 7:36

A priori, on trouve en gros les mêmes valeurs. Je suppose que le calcul est plus ou moins précis selon les logiciels. Pour systat j'ai fais 4 colonnes : une colonne sujet (qui n'est pas utilisée), une colonne côté (le facteur latéralité : droite gauche), une colonne O2_1 (première mesure O2, une colonne O2_2 (deuxième mesure O2).
Les variables dépendantes sont O2_1 et O2_2, marquées comme tels dans le logiciel, le facteur est côté. Un onglet spécifie que les variables sont répétées (spécifié par répétition). Après ça calcule tout seul...
L'interprétation est qu'il n'y apas d'effet droite-gauche (les paramètres sont les mêmes, ni d'effet de la répétition des mesures.

Eric Pagot

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Message par thekeoch le Mer 5 Aoû - 12:18

Merci eric pour tes explications.
Mais j'ai encore une question: si tu n'utilise pas la colonne "sujets" est ce encore une anova à mesures répétés?
a+
Cordialement

thekeoch

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Message par Eric Pagot le Mer 5 Aoû - 15:14

Oui, bien sûr puisque le nombre de sujets correspond au nombre d'éléments dans les variables O2_

Eric Pagot

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