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ACP
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ACP
Bonjour à tous !
Je cherche à analyser (sur R) l'effet des niveaux d'eau d'un marais sur les effectifs d'oiseaux d'eau nicheurs.
Pour ça j'ai donc mon effectif de l'espèce d'oiseaux par année, ainsi qu'une colonne pour chaque niveau d'eau par semaine.
En gros mon jeu de données ressemble à ça :
Effectif_de_l'espece Eau_S1 Eau_S2 ...
45 2.35 2.29
29 2.02 2.08
...
Et il faut savoir qu'il y a des données manquantes pour les niveaux d'eau de certaines semaines
Je me suis donc tournée vers une ACP. Seulement je me rends compte que je n'y comprends pas grand chose, voire que mon jeu de données n'est pas adapté pour l'ACP (c'était plus facile en cours ^^).
Enfin bon, j'ai essayé:
>res.PCA<-PCA(O_VH)
Donc là j'ai obtenu le graphiques des variables et des individus.
Mais ensuite je ne sais pas trop quoi faire pour pouvoir interpréter tout ça.
Je sais que je peux faire plotellipse pour voir les différents groupes de mes variables, mais justement là ça coince :
>plotellipses(res.PCA)
NULL
Et je me dis qu'il me manque peut-être des variables pour effectuer l'ACP?
J'espère avoir été claire dans mes explications
Je remercie d'avance ceux qui essaieront de m'éclairer
Je cherche à analyser (sur R) l'effet des niveaux d'eau d'un marais sur les effectifs d'oiseaux d'eau nicheurs.
Pour ça j'ai donc mon effectif de l'espèce d'oiseaux par année, ainsi qu'une colonne pour chaque niveau d'eau par semaine.
En gros mon jeu de données ressemble à ça :
Effectif_de_l'espece Eau_S1 Eau_S2 ...
45 2.35 2.29
29 2.02 2.08
...
Et il faut savoir qu'il y a des données manquantes pour les niveaux d'eau de certaines semaines
Je me suis donc tournée vers une ACP. Seulement je me rends compte que je n'y comprends pas grand chose, voire que mon jeu de données n'est pas adapté pour l'ACP (c'était plus facile en cours ^^).
Enfin bon, j'ai essayé:
>res.PCA<-PCA(O_VH)
Donc là j'ai obtenu le graphiques des variables et des individus.
Mais ensuite je ne sais pas trop quoi faire pour pouvoir interpréter tout ça.
Je sais que je peux faire plotellipse pour voir les différents groupes de mes variables, mais justement là ça coince :
>plotellipses(res.PCA)
NULL
Et je me dis qu'il me manque peut-être des variables pour effectuer l'ACP?
J'espère avoir été claire dans mes explications
Je remercie d'avance ceux qui essaieront de m'éclairer
Léa- Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 10/07/2023
Re: ACP
Vous ne dites pas ce que c'est que "O_VH". C'est donc dur de vous aider.
Ceci dit, une acp n'est juste qu'une méthode descriptive, alors que vous voulez "analyser". Décrire n'analyse rien.
Vous voulez savoir si les niveaux d'eau ont une influence sur les effectifs d'oiseaux, j'imagine que vous voulez dire "une influence significative". Une acp ne vous produira aucun test statistique pour aborder votre question.
Vous êtes plutôt dans le cadre d'une régression, je pense.
En supposant que les effectifs d'oiseaux suivent des lois normales, vous être donc dans une simple régression multiple, avec des modèles qui ont la forme :
Essayer de creuser cette approche, au besoin en vous appuyant sur vos cours, et tenez-nous au courant.
HTH, Eric.
Ceci dit, une acp n'est juste qu'une méthode descriptive, alors que vous voulez "analyser". Décrire n'analyse rien.
Vous voulez savoir si les niveaux d'eau ont une influence sur les effectifs d'oiseaux, j'imagine que vous voulez dire "une influence significative". Une acp ne vous produira aucun test statistique pour aborder votre question.
Vous êtes plutôt dans le cadre d'une régression, je pense.
En supposant que les effectifs d'oiseaux suivent des lois normales, vous être donc dans une simple régression multiple, avec des modèles qui ont la forme :
- Code:
lm(Effectif_de_l'espece ~ Eau_S1 + Eau_S2 + ...)
Essayer de creuser cette approche, au besoin en vous appuyant sur vos cours, et tenez-nous au courant.
HTH, Eric.
Eric Wajnberg- Nombre de messages : 1238
Date d'inscription : 14/09/2012
Re: ACP
Pardon, oui effectivement j'ai oublié de le préciser mais O_VH est mon jeu de données sous la forme présentée juste au dessus au début de mon premier message.
Effectivement une régression multiple semble plus appropriée, je vais approfondir ça.
Effectivement une régression multiple semble plus appropriée, je vais approfondir ça.
Léa- Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 10/07/2023
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