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librairie limma
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librairie limma
Bonjour, je ne suis pas encore très habitué à R et je viens d'installer la libraire limma car j'aimerais utiliser la fonction voom qui normalise des données génétiques.
Cependant, quand j'éxecute ma fonction voom :
Il me dit qu'il ne trouve pas la fonction voom.
Pourtant ??voom me renseigne bien une page d'aide
Merci d'avance....
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("limma")
Cependant, quand j'éxecute ma fonction voom :
v <- voom(mrna, design, plot=TRUE)
Il me dit qu'il ne trouve pas la fonction voom.
Error: could not find function "voom"
Pourtant ??voom me renseigne bien une page d'aide
Help pages:
limma::voom Transform RNA-Seq Data Ready for Linear Modelling
limma::voomWithQualityWeights Combining observational-level with sample-specific quality weights for RNA-seq analysis
limma::vooma Convert Mean-Variance Trend to Observation-specific Precision Weights for Microarray Data
Merci d'avance....
Cracramon- Nombre de messages : 24
Date d'inscription : 11/01/2016
Re: librairie limma
Bonjour,
biocLite c'est pour installer la librairie mais si tu veux faire appel aux fonctions de cette librairie il te faut faire library(limma).
cdlt
biocLite c'est pour installer la librairie mais si tu veux faire appel aux fonctions de cette librairie il te faut faire library(limma).
cdlt
droopy- Nombre de messages : 1156
Date d'inscription : 04/09/2009
Re: librairie limma
Merci beaucoup droopy... Je me sens un peu bête pour le coup.
Cracramon- Nombre de messages : 24
Date d'inscription : 11/01/2016
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