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Kruskal-Wallis et Mann-Whitney pairwise post-hoc tests
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Kruskal-Wallis et Mann-Whitney pairwise post-hoc tests
Bonjour à toutes et tous,
Data: Un lac est echantillonné à 3 dates différentes. A chaque date 5 profondeurs distinctes sont echantillonnées de manière indépendante. Pour chaque profondeur 3 replicats indépendants.
Question que je me pose: Existe t'il une différence entre les dates et entre les profondeurs pour la parmètre suivi? (Parametre quantitatif)
Test Stat utilisé: Non paramétrique: Kruskal-Wallis suivi d'une comparaison par pair de Mann Whitney avec correction de bonferonni.
Question face à laquelle je reste sans réponse: Lorsque je fais le test de Kruskal-Wallis PAST (logiciel utilisé) me dit qu'il existe une différence significative des variances. Mais lorsque je fait la comparaison par pair Mann-Whitney, et bien je ne trouve aucune différence significative nulpart.
Quelqu'un pourrait il m'expliquer pourquoi?
Data: Un lac est echantillonné à 3 dates différentes. A chaque date 5 profondeurs distinctes sont echantillonnées de manière indépendante. Pour chaque profondeur 3 replicats indépendants.
Question que je me pose: Existe t'il une différence entre les dates et entre les profondeurs pour la parmètre suivi? (Parametre quantitatif)
Test Stat utilisé: Non paramétrique: Kruskal-Wallis suivi d'une comparaison par pair de Mann Whitney avec correction de bonferonni.
Question face à laquelle je reste sans réponse: Lorsque je fais le test de Kruskal-Wallis PAST (logiciel utilisé) me dit qu'il existe une différence significative des variances. Mais lorsque je fait la comparaison par pair Mann-Whitney, et bien je ne trouve aucune différence significative nulpart.
Quelqu'un pourrait il m'expliquer pourquoi?
asterio- Nombre de messages : 1
Date d'inscription : 27/01/2017
Re: Kruskal-Wallis et Mann-Whitney pairwise post-hoc tests
Un test de Kruskal-Wallis compare des moyennes. On ne voit donc pas pourquoi un logiciel vous répondrait qu'il existe une différence de variances. Il y a un problème ici.
Pourquoi Kruskal-Wallis? C'est un test non-paramétrique. Pourquoi pas une ANOVA?
On peut avoir un test global (Kruskal-Wallis) significatif mais pas de différences deux à deux (Mann-Whitney). Ce sont des procédures sensiblement différentes et la correction de Bonferroni appliquée sur les tests de Mann-Whitney leur fait perdre de la puissance.
Je pense que vous êtes plutôt dans un schéma d'ANOVA à deux facteurs (date et profondeur), voire un modèle mixte ou la date est un facteur aléatoire.
Cordialement, Eric.
Pourquoi Kruskal-Wallis? C'est un test non-paramétrique. Pourquoi pas une ANOVA?
On peut avoir un test global (Kruskal-Wallis) significatif mais pas de différences deux à deux (Mann-Whitney). Ce sont des procédures sensiblement différentes et la correction de Bonferroni appliquée sur les tests de Mann-Whitney leur fait perdre de la puissance.
Je pense que vous êtes plutôt dans un schéma d'ANOVA à deux facteurs (date et profondeur), voire un modèle mixte ou la date est un facteur aléatoire.
Cordialement, Eric.
Eric Wajnberg- Nombre de messages : 1238
Date d'inscription : 14/09/2012
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