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normaliser ses données

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Message par Jennifer05 Mer 9 Juil 2014 - 14:19

Bonjour,
Je ne suis pas sur que le terme du sujet soit vraiment correct, mais voila ce que je cherche à faire.
Je travail en biologie - immunologie.
Il faut comprendre que chaque individu a sa propre immunité, son propre taux de base. C'est pourquoi, j'ai sur un même individu des données témoins (Neg) et des données traités (Inj). Je souhaite "normaliser" mes données traités Inj par les données témoins Neg. Ce qui me permettrai de mieux comparer l'effet Inj entre individu et voir s'il y a des différences significatives entre mes individus.

Ex:
Individu 1: Neg= 15 et Inj = 25
Individu 2: Neg= 18 et Inj = 30
Individu 3: Neg= 11 et Inj = 28
ect...

Sauf que je ne vois pas comment faire.
Auriez vous un conseil?

Merci et bonne soirée

Jennifer05

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Message par c@ssoulet Mer 9 Juil 2014 - 14:24

Tu ne pourras pas mettre en évidence des différences significatives entre individus. Ce que l'on peut faire, c'est mettre en évidence des diffs entre GROUPES. Et il faut que l'appartenance à un groupe ait été fixée à l'avance, pas à postériori.

c@ssoulet

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Message par Jennifer05 Mer 9 Juil 2014 - 14:28

Je ne voulais pas donner trop de détails pour rester clair, mais je n'ai pas donner assez apparemment.
J'ai déjà 3 groupes bien définit et bien entendu ce sont les groupes que je cherche à distinguer.
J'aurai du le dire, tu as raison de le faire remarquer.

Jennifer05

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Message par c@ssoulet Mer 9 Juil 2014 - 14:34

Dans ce cas tu veux comparer 3 groupes, et pour chaque individu tu as répété 2 mesures dans des conditions différentes (neg et inj). Il faut faire une analyse de variance en mesures répétées, avec groupe en facteur inter et condition (neg/inj) en facteur intra.

Combien tu as de sujets par groupe ?

c@ssoulet

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Message par Jennifer05 Mer 9 Juil 2014 - 14:43

groupe 1 = 3 individus
groupe 2 = 3 individus
groupe 3 = 2 individus

Par contre j'ai entre 1 à 3 inj par individu. Vu que je regarde des réactions hyper localisé, on peut les considérer comme des réplicats.

Je sais que c'est vraiment peu mais les conditions expérimental ont fait que je n'ai pas pu avoir plus.

Jennifer05

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Message par c@ssoulet Jeu 10 Juil 2014 - 7:26

C'est pas assez pour faire des stats. Il faut se contenter de décrire les évolutions.

c@ssoulet

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Message par Jennifer05 Jeu 10 Juil 2014 - 7:41

Si j'augmente à 5 - 5 et 4, cela pourrai aller?
J'ai 2 essais et je peux cumuler les groupes des 2 essais. Mes autres données ont montré que les groupes ont des tendances similaires suivant l'essai.

Je ne vais faire quasiment que du descriptif sur toutes mes données, mais sur celles ci, sachant que j'ai des réplicats par individu, je me demandais si c'était possible de faire un peu de stat.

Seconde question : Tu penses que je peux faire quand même l'analyse de variance en mesure répété que tu m'as suggérer au début, pour pouvoir mieux décrire les évolutions entre groupes?

Jennifer05

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Message par 12010929 Jeu 10 Juil 2014 - 12:55

il te faut au moins 30 observations pour celà et encore!

12010929

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Message par Jennifer05 Jeu 10 Juil 2014 - 15:35

Si cela était possible, tous les biologistes seraient les plus heureux du monde!
En tout cas merci de vos remarques, j'en prend notes

Jennifer05

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Message par c@ssoulet Ven 11 Juil 2014 - 8:35

Tu peux faire avec moins de 30. Si l'évolution de l'un des groupes est radicalement différente des autres, ca peut sortir avec des effectifs de 6-8 / groupe.

Mais lorsqu'on travaille avec des effectifs proches de la limite basse, les assomptions des tests sont difficiles à vérifier et on flirte avec la limite de ce qui est acceptable ou pas. Ca demande un peu d'habitude pour trancher, et il vaut mieux se faire aider que faire du pif sur un coin de paillasse.

A mon avis, si tu arrives à avoir 6 patients par groupe, ca peut valoir le coup de jeter un coup d'oeil.

c@ssoulet

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