Clustering

Bonjour,

Quelqu'un pourrait me renseigner sur comment faire un clustering sur une base de données constituée de la manière suivante :


colonne 1 colonne 2 colonne 3
STATION ESPECE CONCENTRATION
ST1 SP1 25
ST1 SP1 34
ST1 SP1 19
ST1 SP1 23
ST1 SP2 31
ST1 SP2 29
ST1 SP2 26
ST1 SP2 37
ST1 SP3 12
ST1 SP3 17
ST1 SP3 23
ST2 SP1 12
ST2 SP1 14
ST2 SP1 09
ST2 SP2 18
ST2 SP2 19
ST2 SP2 24
ST2 SP3 09
ST2 SP3 11
ST2 SP3 06
ST2 SP4 35
ST2 SP4 29
ST2 SP4 32
ST2 SP4 28
etc....

La colonne 1 concerne les références des stations de prélèvements
La colonne 2 concerne les espèces prélevées. Les espèces étant prélevées sur plusieurs stations
La colonne 3 concerne les valeurs de concentrations en Cadmium

Donc pour chaque station on a n espèces avec n répétions

Je n'arrive pas à formaliser un dendrogramme me permettant de dire si une des espèces accumule plus de Cadmium que les autres.

Merci de votre aide

Bonjour, François Husson, le créateur du package FactoMineR donne des cours sur youtube

https://www.youtube.com/playlist?list=PLnZgp6epRBbQu2QtCyqYL80In1P-A_Iud&feature=view_all

Il explique tout sur les FAMD (le cas que tu dois utiliser il me semble) ainsi que le clustering à réaliser par la suite.