Test non param ou ANOVA ?

Bonjour,

Voilà mon problème :

J'ai deux espèces de plantes pour lesquelles j'ai entre 12 et 20 observation
de différente variables : hauteur, biomasse... ces dernière ne suivent PAS une loi normale !

Pensez vous qu'il vaut mieux faire un test non paramétrique du genre kuskal wallis ou plutot essayez de transformé mes variables afin qu'elles suivent une loi normale puis de faire une ANOVA ?


Un tout grand merci parce que je galère vraiment depuis quelques semaines !

en général on essaie de rester en paramétrique ou la puissance des tests est plus fortes. Si tu cherches a faire des ANOVAS la non normalité des données (faut pas non plus que ça soit pathologique) n'est pas un réel problème, le plus important est l'homoscédasticité. Si tu as cette égalités des variances alors et même si tes donneés ne sont pas normales alors reste plutôt sur une ANOVA. Après il ya aussi des variables pour lesquelles les transformations ne sont pas abbérantes. Parler du log d'une taille a priori ne choquera pas grand monde.

micros

En fait c'est vraiment pathologique (enfin je crois) : la biomasse
par exemple suit une distribution contagieuse et présente de
l'hétéroscédasticité... Quand je la transforme (LN (X+1)) sa suit une loi normal mais est-ce que si je fais l'anova sur cette dernière je peut me contenter du résultat tel quel ou bien est ce
que aprés je doit refaire une transformation inversse ... et dans ce cas comment procéde-t-on ?


Merci beaucoup pour ton aide

Lucius

S'il s'agit de la biomasse je pense que ça choquera personne que de travailler sur des log. Et concernant l'ANOVA tu gardes les résultats tels quel une transformation inverse n'aurait pas de sens. Après si tu tests sur cette biomasse pas mal de facteurs n'oublie pas les problèmes de comparaisons multiples.

Bonjour,

Comment puis-je faire pour tester l'hoscédasticité de ma variables avant de faire l'ANOVA... En fait si je prend par exemple la variable pH que je test par rapport à 2 facteur (2 type de sol différent) sa ne me fais qu'un seul vecteur pH... donc je vois pas
trés bien comment je fais mon test parce que partout il marque tester sur les résidus mais là j'ai pas de résidus...?

Merci

Si tu as deux types de sol, tu as un seul facteur qui prend deux modalités, ce qui n'est pas la même chose que deux facteurs. Le tout est de tester au préalable si la variance du pH est la même entre tes deux types de sol. Si ce n'est pas le cas il n'est pas recommander d'utiliser une ANOVA, tes conclusions seront biaisées. Des tests pour vérifier l'homogénéité de variance ce n'est pas ce qui manque, je t'en cite deux aux passages : le test de Bartlett (qui est sensible à la normalité des données) et le test de Levenne. Tout ces tests se trouvent dans les logiciels de stats en général.

D'accord !

et si le test de Levene est négatif je peux faire un T-test ?

Merci

Il y a des fonctions qui calcul le test t en prenant en compte l'hétérogénéité des variance entre les deux échantillons pour le calcul des degrés de liberté. Perso je ne sais pas ce que ça vaut.

donc si les variances sont pas les même, on fait un test non paramétrique, il n'y a pas d'autres solutions ?

tu peux utiliser le test t avec correction sur les degré de liberté ou test non paramétrique.

en cherchant vite fait sur google voici ce que j'ai trouvé :
http://www.cons-dev.org/elearning/stat/parametrique/5-2/5-2.html

micros