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ACP sous R : message d'erreur
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ACP sous R : message d'erreur
Bonjour !
Petite question : j'ai réussi -enfin- à mener des acp et obtenir des graphes qui me vont à peu près, seulement il arrive que pour certains assemblages de mesures il refuse de mener l'acp. Il écrit :
> acp1=nipals(AvInd[,-c(1,2,3,4,5,6,8,9,11,13,14,16,17,19,20,21,22)],nf=2)
Erreur dans nipals(AvInd[, -c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 11, 13, 14, 16, 17, :
Maximum number of iterations reached for axis 1
Je en vois pas ce qui le perturbe...(dans l'acp que je veux mener par exemple ici je retiens 6 variables) Quelqu'un aurait-il une suggestion ? Cordialement !
Petite question : j'ai réussi -enfin- à mener des acp et obtenir des graphes qui me vont à peu près, seulement il arrive que pour certains assemblages de mesures il refuse de mener l'acp. Il écrit :
> acp1=nipals(AvInd[,-c(1,2,3,4,5,6,8,9,11,13,14,16,17,19,20,21,22)],nf=2)
Erreur dans nipals(AvInd[, -c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 11, 13, 14, 16, 17, :
Maximum number of iterations reached for axis 1
Je en vois pas ce qui le perturbe...(dans l'acp que je veux mener par exemple ici je retiens 6 variables) Quelqu'un aurait-il une suggestion ? Cordialement !
Pechou- Nombre de messages : 20
Date d'inscription : 20/07/2011
Re: ACP sous R : message d'erreur
Salut,
Sans les données, difficile de répondre...
nik
Sans les données, difficile de répondre...
nik
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
Re: ACP sous R : message d'erreur
Malheureusement mon tableau est trop grand pour que je puisse le coller ici (et que ce soit cohérent je veux dire!)...!
Pechou- Nombre de messages : 20
Date d'inscription : 20/07/2011
Re: ACP sous R : message d'erreur
Ceci dit pourquoi ne teste tu pas la librairie ade4 ?
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
Re: ACP sous R : message d'erreur
On m'a conseillé d'utiliser nipals vu que j'ai pas mal de NA car je ne pouvais pas effectuer toutes mes mesures sur toutes mes empreintes à cause de leur qualité. Et supprimer les NA reviendrait donc à m'enlever beaucoup de données (car ce n'est pas parce-que j'ai une mesure qui me manque que je n'ai pas toutes les autres) alors que je n'ai déjà pas d'individus que ça.
Pechou- Nombre de messages : 20
Date d'inscription : 20/07/2011
Re: ACP sous R : message d'erreur
Si tu ne veux pas être gêné par les valeurs manquante tu peux les remplacer par la moyenne générale. Ces valeurs ne devraient pas interférer dans l'analyse.
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
Re: ACP sous R : message d'erreur
Nipals ne fait pas quelque chose du même type ? Il me semble qu'il estime les valeurs manquantes sans que ça fausse la donne.
Pechou- Nombre de messages : 20
Date d'inscription : 20/07/2011
Re: ACP sous R : message d'erreur
regarde du coté du package FactoMineR, il gere bien les valeurs manquantes ( parfois )
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