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Manipulation des données après importation d'excel
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Manipulation des données après importation d'excel
Bonjour,
Je débute avec R et j'ai donc quelques difficultés à utiliser le logiciel. L'expérience est la suivante je veux comparer la croissance de larves de crustacés de 2 pools de géniteurs d'origine différentes. Pour cela j'ai des triplicats de bassin pour chaque pool. Les crustacés ont une croissance discontinue (mue). Il y a 12 stades larvaires. j'ai donc 90 données par pool par stades. J'ai créé un fichier excel pour chaque stade. Il y a un tableau à 2 colonnes "V1" et "V2". Dans chaque colonne il y a 90 mesures. Je voudrais savoir si il y a une différence significative. Pour chaque stade.
#J'ai transformé les fichier en .csv et utilisé la commande
>stage10<-read.csv(Fichier,header=TRUE,sep=";",dec=",")
#ensuite pour visualiser les données je tape
>stage10
V1 V2
1 1.750 1.575
2 1.700 1.500
3 1.750 1.650
4 1.750 1.675
5 1.700 1.375
6 1.725 1.625
7 1.775 1.700
8 1.625 1.750
9 1.625 1.700
10 1.725 1.575
...
#maintenant je voudrais faire un t-test
>t.test[V1,V2]
#ça me met une erreur
Erreur : objet 'V1' introuvable
Comment dois je faire pour qu'il considère la colonne V1 comme un objet?
Pensez vous qu'une comparaison de moyenne est suffisante ou vaut il mieux faire une ANOVA?
Merci
Je débute avec R et j'ai donc quelques difficultés à utiliser le logiciel. L'expérience est la suivante je veux comparer la croissance de larves de crustacés de 2 pools de géniteurs d'origine différentes. Pour cela j'ai des triplicats de bassin pour chaque pool. Les crustacés ont une croissance discontinue (mue). Il y a 12 stades larvaires. j'ai donc 90 données par pool par stades. J'ai créé un fichier excel pour chaque stade. Il y a un tableau à 2 colonnes "V1" et "V2". Dans chaque colonne il y a 90 mesures. Je voudrais savoir si il y a une différence significative. Pour chaque stade.
#J'ai transformé les fichier en .csv et utilisé la commande
>stage10<-read.csv(Fichier,header=TRUE,sep=";",dec=",")
#ensuite pour visualiser les données je tape
>stage10
V1 V2
1 1.750 1.575
2 1.700 1.500
3 1.750 1.650
4 1.750 1.675
5 1.700 1.375
6 1.725 1.625
7 1.775 1.700
8 1.625 1.750
9 1.625 1.700
10 1.725 1.575
...
#maintenant je voudrais faire un t-test
>t.test[V1,V2]
#ça me met une erreur
Erreur : objet 'V1' introuvable
Comment dois je faire pour qu'il considère la colonne V1 comme un objet?
Pensez vous qu'une comparaison de moyenne est suffisante ou vaut il mieux faire une ANOVA?
Merci
Matangi- Nombre de messages : 4
Date d'inscription : 08/07/2010
Re: Manipulation des données après importation d'excel
Plusieurs solutions... En vrac car je n'ai pas essayé...
- Utiliser les parenthèses
- Spécifier l'origine des données
Voila, ça devrait marcher.
A priori, deux groupes, donc un test de student est suffisant (selon gg, j'ai découvert ça il y a qq jours...)
Bon courage
Cordialement,
Hadrien
- Utiliser les parenthèses
- Code:
resultat <- t.test(V1,V2)
- Spécifier l'origine des données
- Code:
resultat <- t.test(x=V1, y=VV2, data=stage10)
Voila, ça devrait marcher.
A priori, deux groupes, donc un test de student est suffisant (selon gg, j'ai découvert ça il y a qq jours...)
Bon courage
Cordialement,
Hadrien
Invité- Invité
Re: Manipulation des données après importation d'excel
Erf en effet il suffisait de mettre des parenthèses merci pour ton aide
Matangi- Nombre de messages : 4
Date d'inscription : 08/07/2010
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