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package R modele COX
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package R modele COX
par Sara.b Mer 20 Avr 2011 - 13:34
Bonjour,
Rob Tibshirani propose d'utiliser la pénalisation LASSO pour le modèle COX pour la sélection de variable dans son article "The lasso method for variable selection in the Cox model" published in Statistics In Medicine 16:385.
La fonction lars() nous permet d'utiliser la méthode lasso mais pas pour le modèle cox. Est ce que quelqu'un connait un package R ou une fonction sur R qui me permettrait d'appliquer lasso sur cox?
Merci !
Rob Tibshirani propose d'utiliser la pénalisation LASSO pour le modèle COX pour la sélection de variable dans son article "The lasso method for variable selection in the Cox model" published in Statistics In Medicine 16:385.
La fonction lars() nous permet d'utiliser la méthode lasso mais pas pour le modèle cox. Est ce que quelqu'un connait un package R ou une fonction sur R qui me permettrait d'appliquer lasso sur cox?
Merci !
Sara.b- Nombre de messages : 5
Date d'inscription : 09/04/2011
Re: package R modele COX
par Invité Mer 20 Avr 2011 - 13:48
Apparemment le package "penalized fait cela,
tu pourras trouver de la doc ici:
http://cran.r-project.org/web/packages/penalized/penalized.pdf
et le télécharger ici:
http://cran.r-project.org/web/packages/penalized/index.html
tu pourras trouver de la doc ici:
http://cran.r-project.org/web/packages/penalized/penalized.pdf
et le télécharger ici:
http://cran.r-project.org/web/packages/penalized/index.html
Invité- Invité
Sara.b- Nombre de messages : 5
Date d'inscription : 09/04/2011
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