transformation de Hellinger

Bonjour, est-ce que quelqu'un a déjà utilisé la transformation de Hellinger pour des données d'abondance? J'ai entendu du positif et du négatif à ce sujet et je recherche quelquess avis "éclairés", mon professeur m'ayant répondu qu'il fallait que "j'essaie de l'utiliser et que je verrai bien ce que ça donne", ce qui ne m'aide pas particulièrement à comprendre...
Merci

Je ne l'ai pas utilisée mais il en est question en partie dans l'article de Peres-Neto et al. 2006 dans ecology.

Merci bcp. Le "problème" (qui n'en est pas formcément un ), c'est que la plupart des articles qui "louent" l'utilisation de cette transformation sont coécrits par Legendre qui l'utilise abondamment. J'aurais aimé avoir un avis plus "neutre"

C'est pas une publi mais ça se cite aussi : congrès de l'ESA

Merci, je venais de la lire . Et j'avoue qu'elle me plonge dans l'embarras, car je viens d'avoir une discussion avec des collègues qui m'assurent qu'une PCA est bien meilleure qu'une analyse NMDS. De plus, NMDS permet une simple ordination, mais n'a pas de méthode associée pour une analyse contrainte? Le rejet de la méthode PCA pousse égalment à rejeter la méthode associée, RDA. Ou ferais-tu une RDA à partir d'une matrice de dissimilarités utilisant la distance Bray-Curtis?
J'ai l'impression de nager dans la choucroute

Ou ferais-tu une RDA à partir d'une matrice de dissimilarités utilisant la distance Bray-Curtis?

...comment te dire. Si cette fois ci tu veux t'orienter vers les indices de dissimilarité je vais encore rajouter de la choucroute: le fait est que tous ces indices (ou distance) ne sont pas linéaire quant à leur capacité à distinguer des assemblages quand le nombre d'espèces (taxon) augmente. Au final, ils sont tous incapable de distinguer des assemblages taxonomiquement riches. Donc en les utilisants tu poses l'hypothèse que les assemblages diversifiés sont moins différents entre eux que les assemblages taxonomiquement pauvres.
Il n'y a pas de solution à ce problème, en tout cas pas pour le moment.

Pour le NMDS, je ne l'ai personnellement jamais utilisé certainement parce que j'appartient à l'école Lyonnaise qui est plutôt orienté sur l'ACP. Donc je ne donne pas d'avis là dessus pour le moment. Je vais quand même regarder ça pour avoir une idée plus précise de ce que fait le NMDS.

Nik