Forum de Statistiques
Vous souhaitez réagir à ce message ? Créez un compte en quelques clics ou connectez-vous pour continuer.
Les posteurs les plus actifs de la semaine
Aucun utilisateur


ACP

2 participants

Aller en bas

ACP Empty ACP

Message par Léa Lun 10 Juil 2023 - 14:56

Bonjour à tous ! Smile

Je cherche à analyser (sur R) l'effet des niveaux d'eau d'un marais sur les effectifs d'oiseaux d'eau nicheurs.
Pour ça j'ai donc mon effectif de l'espèce d'oiseaux par année, ainsi qu'une colonne pour chaque niveau d'eau par semaine.
En gros mon jeu de données ressemble à ça : 
    Effectif_de_l'espece    Eau_S1     Eau_S2    ... 
              45                      2.35          2.29
             29                      2.02          2.08
...

Et il faut savoir qu'il y a des données manquantes pour les niveaux d'eau de certaines semaines
Je me suis donc tournée vers une ACP. Seulement je me rends compte que je n'y comprends pas grand chose, voire que mon jeu de données n'est pas adapté pour l'ACP (c'était plus facile en cours ^^).

Enfin bon, j'ai essayé:
>res.PCA<-PCA(O_VH)

Donc là j'ai obtenu le graphiques des variables et des individus. 
Mais ensuite je ne sais pas trop quoi faire pour pouvoir interpréter tout ça.
Je sais que je peux faire plotellipse pour voir les différents groupes de mes variables, mais justement là ça coince : 
>plotellipses(res.PCA)
NULL

Et je me dis qu'il me manque peut-être des variables pour effectuer l'ACP?

J'espère avoir été claire dans mes explications
Je remercie d'avance ceux qui essaieront de m'éclairer Very Happy



Léa

Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 10/07/2023

Revenir en haut Aller en bas

ACP Empty Re: ACP

Message par Eric Wajnberg Mar 11 Juil 2023 - 5:29

Vous ne dites pas ce que c'est que "O_VH". C'est donc dur de vous aider.

Ceci dit, une acp n'est juste qu'une méthode descriptive, alors que vous voulez "analyser". Décrire n'analyse rien.

Vous voulez savoir si les niveaux d'eau ont une influence sur les effectifs d'oiseaux, j'imagine que vous voulez dire "une influence significative". Une acp ne vous produira aucun test statistique pour aborder votre question.

Vous êtes plutôt dans le cadre d'une régression, je pense.

En supposant que les effectifs d'oiseaux suivent des lois normales, vous être donc dans une simple régression multiple, avec des modèles qui ont la forme :

Code:
lm(Effectif_de_l'espece ~ Eau_S1 + Eau_S2 + ...)

Essayer de creuser cette approche, au besoin en vous appuyant sur vos cours, et tenez-nous au courant.

HTH, Eric.
Eric Wajnberg
Eric Wajnberg

Nombre de messages : 1238
Date d'inscription : 14/09/2012

Revenir en haut Aller en bas

ACP Empty Re: ACP

Message par Léa Mar 11 Juil 2023 - 10:09

Pardon, oui effectivement j'ai oublié de le préciser mais O_VH est mon jeu de données sous la forme présentée juste au dessus au début de mon premier message.

Effectivement une régression multiple semble plus appropriée, je vais approfondir ça.

Léa

Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 10/07/2023

Revenir en haut Aller en bas

ACP Empty Re: ACP

Message par Contenu sponsorisé


Contenu sponsorisé


Revenir en haut Aller en bas

Revenir en haut


 
Permission de ce forum:
Vous ne pouvez pas répondre aux sujets dans ce forum