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Médiane et Boxplot sur R
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Médiane et Boxplot sur R
Chers utilisateurs de R,
J'écris sur votre forum parce que je ne trouve pas de solution à mon problème. J'essaie de représenter graphiquement le temps de capture médian (TCM) des moustiques que nous (mon équipe et moi) avons collecté (je suis actuellement en stage pour étudier le paludisme en Côte d'Ivoire. Soit le temps où 50% des moustiques ont été capturés.
Par exemple, nous avons collecté cet échantillon :
Heure de la collecte Nombre de moustiques
20H-21H 1
21H-22H 1
22H-23H 2
23H-00H 2
00H-01H 13
01H-02H 10
02H-03H 15
03H-04H 15
04H-05H 8
05H-06H 10
06H-07H 6
Ici, l'effectif cumulé est de 83 moustiques. Et je suppose que la médiane de cette série de moustiques est de 83+1/2 = 42 (Je ne trouve même pas ce résultat sur R…), il en résulte un temps de capture médian de 2 heures du matin (02h00).
J'ai ensuite essayé d'utiliser la fonction "boxplot" avec différents paramètres, mais je n’arrive pas à obtenir ce que je veux représenter. En effet, j'ai des boites pour chaque heure de collecte alors que je veux la représentation de l'effectif cumulé au cours du temps de collecte. Et le référentiel de temps dans R est "20H-21H" = 20, "21H-22H" = 21 etc.
J'ai trouvé un article (Nicolas Moiroux, 2012) qui présente le temps médian de collecte et un boxplot que j'aimerais avoir. Je joins l'image du boxplot cité à mon message.
Merci par avance pour l’aide que vous pourrez m’apporter et d’ici là je vous présente mes sincères salutations.
Edouard
J'écris sur votre forum parce que je ne trouve pas de solution à mon problème. J'essaie de représenter graphiquement le temps de capture médian (TCM) des moustiques que nous (mon équipe et moi) avons collecté (je suis actuellement en stage pour étudier le paludisme en Côte d'Ivoire. Soit le temps où 50% des moustiques ont été capturés.
Par exemple, nous avons collecté cet échantillon :
Heure de la collecte Nombre de moustiques
20H-21H 1
21H-22H 1
22H-23H 2
23H-00H 2
00H-01H 13
01H-02H 10
02H-03H 15
03H-04H 15
04H-05H 8
05H-06H 10
06H-07H 6
Ici, l'effectif cumulé est de 83 moustiques. Et je suppose que la médiane de cette série de moustiques est de 83+1/2 = 42 (Je ne trouve même pas ce résultat sur R…), il en résulte un temps de capture médian de 2 heures du matin (02h00).
J'ai ensuite essayé d'utiliser la fonction "boxplot" avec différents paramètres, mais je n’arrive pas à obtenir ce que je veux représenter. En effet, j'ai des boites pour chaque heure de collecte alors que je veux la représentation de l'effectif cumulé au cours du temps de collecte. Et le référentiel de temps dans R est "20H-21H" = 20, "21H-22H" = 21 etc.
J'ai trouvé un article (Nicolas Moiroux, 2012) qui présente le temps médian de collecte et un boxplot que j'aimerais avoir. Je joins l'image du boxplot cité à mon message.
Merci par avance pour l’aide que vous pourrez m’apporter et d’ici là je vous présente mes sincères salutations.
Edouard
Edouard94- Nombre de messages : 1
Date d'inscription : 27/02/2020
Re: Médiane et Boxplot sur R
Salut Edouard,
Essaye ça :
A+
Edouard94 a écrit: je veux la représentation de l'effectif cumulé au cours du temps de collecte
Essaye ça :
- Code:
x.name <- deparse(substitute(x$time))
n <- length(x$nombre)
plot( 1:n ~ sort(x$time), xlab=x.name, ylab='effectifs cumulés')
abline(v=median(x$nombre))
A+
letolah- Nombre de messages : 6
Date d'inscription : 02/03/2020
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