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Message par Vassily le Jeu 12 Avr 2012 - 13:50

Bonjour,

Je suis débutant en R, et je rencontre un problème pour importer un fichier excel (ou txt, j'ai essayé les deux) sous R.

j'ai utilisé read.table, mais il ne reconnait pas le nom de fichier il me dit que ça existe pas, alors que je suis dans le bon répertoire. J'ai vérifié le répertoire de travail avec la fonction getwd() et il me dit qu'il est dans Z:/. Du coup j'ai collé mon fichier PAtxt2 dedans.
> getwd()
[1] "Z:/"
Ensuite quand je veux importer ma table, j'écris la commande read.table comme suit: (et voila le message d'erreur)
read.table("PAtxt2")
Erreur dans file(file, "rt") : impossible d'ouvrir la connexion
De plus : Message d'avis :
In file(file, "rt") : impossible d'ouvrir le fichier 'PAtxt2' : No such file or directory

J'ai également vérifié si mon fichier était bien dans le répertoire de travail avec la commande list.files():
list.files()
[1] "desktop.ini" "Ma musique" "Mes images"
[4] "Mes sources de données" "Mes vidéos" "PAtxt2.txt"
[7] "SWWATER.INI" "Téléchargements"

Mon fichier est bien présent, et du coup je ne comprends pas d'où vient le problème???

Pouvez-vous m'aider à résoudre ce problème!

Merci d'avance pour les réponses!

Vassily

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Message par Ayana le Jeu 12 Avr 2012 - 15:02

Il faut que tu précises l'extension de ton fichier: read.table("PAtxt2.txt") et ça devrait marcher...
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Message par Vassily le Ven 13 Avr 2012 - 7:12

Oui merci, effectivement il faut rajouter l'extension du fichier (.txt), mais un autre problème se crée avec la fonction read.table:

read.table("PAtxt2.txt")
Erreur dans scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
la ligne 2 n'avait pas 43 éléments

Du coup, j'ai essayé une autre commande moins sensible à savoir:

read.delim("PAtxt2.txt")

et la ça marche!

Ma question est de savoir pourquoi la commande read.table ne marche pas? que veut dire le message d'erreur?
Erreur dans scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
la ligne 2 n'avait pas 43 éléments

Vassily

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Message par Ayana le Ven 13 Avr 2012 - 7:40

C'est probablement parce que tu dois avoir des données manquantes dans ta table que R crie. Essaie d'ajouter l'option :
read.table("PAtxt2.txt","na.strings = "NA")
en remplaçant le NA par le symbole qui code tes données manquantes dans ta table (par exemple "" si la case est vide ou "." si tes données manquantes sont codées par un point). R codera ensuite toutes les données manquantes par NA (pour non available).
Ayana
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