Test de wilcox sour R

Bonjour,
j'ai fait un test de wilcox en utilisant cette syntaxe suivante et ça a marché.

Code:

wilcox.test(x=tab$FMC[tab$Classe_ech==2],y=tab$FMC[tab$Classe_ech==1],alternative="greater")

Cependant je veux ajouter un deuxième facteur (tab$Site==] en plus du premier facteur qui est [tab$Classe_ech==]

Donc j'ai écrit la syntaxe de cette façon, mais cela ne marche pas:

Code:

wilcox.test(x=tab$FMC[tab$Classe_ech==2,[tab$Site==1]],y=tab$FMC[tab$Classe_ech==1,[tab$Site==1]],alternative="greater")

Je sollicite votre aide pour écrire cette syntaxe.
Merci d'avance

Comme ça ça devrait marcher :

Code:

wilcox.test(x=tab$FMC[tab$Classe_ech==2 & tab$Site==1],y=tab$FMC[tab$Classe_ech==1 & tab$Site==1],alternative="greater")

nik

Bonjour,
J'ai apporté des changement de variables dans ma table mais l'esprit de la question reste le même. Cependant l'opération ne parche toujours pas. Je vous montre un échantillon de mes donnée et le message d'erreur.
Merci encore

Code:

  Site Jour FMC_ligneux FMC_herb Diff_FMC EWT._ligneux EWT._herb Diff_EWT
1    1    1      366.67    23.06  343.61      244.44    56.22  188.22
2    1    2      135.56    39.04    96.52      118.52    57.33    61.19
3    1    3      110.03    53.96    56.07      103.70    59.89    43.81
4    1    4      89.67    38.10    51.57        83.33    43.56    39.77
5    1    5      71.79    80.28    -8.49      107.41    74.33    33.08
6    2    1      87.34    46.18    41.16      149.36    69.50    79.86
7    2    2      88.42    73.16    15.26      121.15    66.50    78

 
 wilcox.test(x=tab$FMC_ligneux[tab$Jour==(1:5)& tab$Site==1],(y=tab$FMC_herb[tab$jour==(1:5)& tab$Site==1],alternative="greater")
Erreur : ',' inattendu(e) dans "wilcox.test(x=tab$FMC_ligneux[tab$Jour==(1:5)& tab$Site==1],(y=tab$FMC_herb[tab$jour==(1:5)& tab$Site==1],"

Bonjour,
Finalement ça marche. Il y avait une parenthèse de plus. Mais dans le résultat, il ya un message d'avis, est ce un problème aussi? voir résultat:

Code:

 Wilcoxon rank sum test

data:  tab$FMC_ligneux[tab$Jour == (1:5) & tab$Site == 1] and tab$FMC_herb[tab$Jour == (1:5) & tab$Site == 1]
W = 24, p-value = 0.007937
alternative hypothesis: true location shift is greater than 0
Messages d'avis :
1: In tab$Jour == (1:5) :
  la taille d'un objet plus long n'est pas multiple de la taille d'un objet plus court
2: In tab$Jour == (1:5) :
  la taille d'un objet plus long n'est pas multiple de la taille d'un objet plus court


Merci encore

Bonjour,
j'ai un problème pour faire le test de wilcoxon.
je montre d'abord un échantillon des mes données:

Code:

  Site Jour FMC_ligneux FMC_herb Diff_FMC EWT._ligneux EWT._herb Diff_EWT
1    1    1      366.67    23.06  343.61      244.44    56.22  188.22
2    1    2      135.56    39.04    96.52      118.52    57.33    61.19
3    1    3      110.03    53.96    56.07      103.70    59.89    43.81
4    1    4      89.67    38.10    51.57        83.33    43.56    39.77
5    1    5      71.79    80.28    -8.49      107.41    74.33    33.08
6    2    1      87.34    46.18    41.16      149.36    69.50    79.86
7    2    2      88.42    73.16    15.26      121.15    66.50    54.65
8    2    3      96.83    76.23    20.60      139.10    73.50    65.60
9    2    4      100.64    57.51    43.13      109.62    49.75    59.87
10    2    5      105.38    57.93    47.45      112.82    48.75    64.07
11    2    6      95.66    42.74    52.92      110.90    41.75    69.15
12    2    7      87.51    46.41    41.10        92.95    38.75    54.20
13    2    8      75.47    36.69    38.78        76.92    28.50    48.42

j'utilise le code suivant pour faire le test de wilcoxon:

Code:

wilcox.test(x=tab$FMC_ligneux[tab$Jour==(1:5)& tab$Site==1],y=tab$FMC_herb[tab$Jour==(1:5)& tab$Site==1],alternative="greater")

Le résultat est le suivant et je ne comprends pas le message d'avis?

Code:

        Wilcoxon rank sum test

data:  tab$FMC_ligneux[tab$Jour == (1:5) & tab$Site == 1] and tab$FMC_herb[tab$Jour == (1:5) & tab$Site == 1]
W = 24, p-value = 0.007937
alternative hypothesis: true location shift is greater than 0
Messages d'avis :
1: In tab$Jour == (1:5) :
  la taille d'un objet plus long n'est pas multiple de la taille d'un objet plus court
2: In tab$Jour == (1:5) :
  la taille d'un objet plus long n'est pas multiple de la taille d'un objet plus court

Je mets un 2ème code qui lui traite la 2ème partie de mes données:

Code:

 wilcox.test(x=tab$FMC_ligneux[tab$Jour==(6:13)& tab$Site==2],y=tab$FMC_herb[tab$Jour==(6:13)& tab$Site==2],alternative="greater")

Le résultat n'est pas bon:

Code:

Erreur dans wilcox.test.default(x = tab$FMC_ligneux[tab$Jour == (6:13) &  :
  pas assez d'observations 'x' (définies)
De plus : Messages d'avis :
1: In tab$Jour == (6:13) :
  la taille d'un objet plus long n'est pas multiple de la taille d'un objet plus court
2: In tab$Jour == (6:13) :
  la taille d'un objet plus long n'est pas multiple de la taille d'un objet plus court


Pourriez vous me dire où se trouve le problème sur sur le dernier résultat?
Merci d'avance