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ACP interpretation
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ACP interpretation
par davidis1 Mer 4 Juil 2012 - 15:07
Bonjour a tous
question d'un igorant en ACP :
J ai realise une ACP pour la premiere fois : ce sont des genotypes (donnees simulees) sur 300 individus. On dit en genetique statistique que la premiere composante principale fait normalement apparaitre la stratification ethnique .
Das mon graphe de "ACP$scores[,1] vs 1:300" je vois apparaitre distinctement 3 nuages de points pour chaque 100 individus : les 100 premiers idividus autour de 0 les 100 deuxiemes autour de -5 et les cent troisiemes autour de 5
Je n ai aucune idee comment interpreter le graphe
3 groupes ethniques ?
2 et le premier est metisse ?
Merci
question d'un igorant en ACP :
J ai realise une ACP pour la premiere fois : ce sont des genotypes (donnees simulees) sur 300 individus. On dit en genetique statistique que la premiere composante principale fait normalement apparaitre la stratification ethnique .
Das mon graphe de "ACP$scores[,1] vs 1:300" je vois apparaitre distinctement 3 nuages de points pour chaque 100 individus : les 100 premiers idividus autour de 0 les 100 deuxiemes autour de -5 et les cent troisiemes autour de 5
Je n ai aucune idee comment interpreter le graphe
3 groupes ethniques ?
2 et le premier est metisse ?
Merci
davidis1- Nombre de messages : 1
Date d'inscription : 04/07/2012
Re: ACP interpretation
par Nik Mer 4 Juil 2012 - 21:11
on ne peut absolument pas t'aider car cela concerne directement la connaissance des données et pas vraiment les stats.
Essaye de développer un peu ts questions mais c'est mal embarqué à mon avis.
nik
Essaye de développer un peu ts questions mais c'est mal embarqué à mon avis.
nik
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
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