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ACM ou ACP
3 participants
Page 1 sur 1
ACM ou ACP
Bonjour,
Voici un bout de mon tableau :
mois decade saison temp pluie especes
FEV 2 hiver 6.79 22 tircis
FEV 2 hiver 6.79 22 vulcain
MAR 1 hiver 5.47 0 aurore
MAR 1 hiver 5.47 0 vulcain
MAR 2 hiver 9.12 2.4 petite_tortue
MAR 2 hiver 9.12 2.4 vulcain
MAR 3 print 11.2 8.5 aurore
MAR 3 print 11.2 8.5 melitee_plantain
MAR 3 print 11.2 8.5 tircis
MAR 3 print 11.2 8.5 vulcain
AV 1 print 13.8 1.8 aurore
AV 1 print 13.8 1.8 azure_nerpruns
AV 1 print 13.8 1.8 carte_geographique
J'aurais voulu savoir si c'était mieux de faire une ACP ou ACM avec ce type de tableau? pour savoir ce qui peut influencer l'arrivée des papillons suivant le mois, la saison, la température et la hauteur de pluie.
Oui je suis pommée en statistiques --'
Voici un bout de mon tableau :
mois decade saison temp pluie especes
FEV 2 hiver 6.79 22 tircis
FEV 2 hiver 6.79 22 vulcain
MAR 1 hiver 5.47 0 aurore
MAR 1 hiver 5.47 0 vulcain
MAR 2 hiver 9.12 2.4 petite_tortue
MAR 2 hiver 9.12 2.4 vulcain
MAR 3 print 11.2 8.5 aurore
MAR 3 print 11.2 8.5 melitee_plantain
MAR 3 print 11.2 8.5 tircis
MAR 3 print 11.2 8.5 vulcain
AV 1 print 13.8 1.8 aurore
AV 1 print 13.8 1.8 azure_nerpruns
AV 1 print 13.8 1.8 carte_geographique
J'aurais voulu savoir si c'était mieux de faire une ACP ou ACM avec ce type de tableau? pour savoir ce qui peut influencer l'arrivée des papillons suivant le mois, la saison, la température et la hauteur de pluie.
Oui je suis pommée en statistiques --'
boubou- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 05/05/2014
Re: ACM ou ACP
Bonjour
Ce que j'ai compris des analyses factorielles c'est quand on cherche à caracteriser des individus par des variables. genre tel groupe d'athelete sont plus fort en saut et perche contrairement à l'autre groupe ....
Mais quand vous dites influencer, je pense à expliquer: qu'est ce qui explique l'apparition de ces espece en tenant compte des saison, temps, mois.... Et là on pense plutot à faire une regression adaptée à ce type de donnée.
Donc si vous pouvez eclairez davantage sur le resultat que vous voulez obtenir...?
Ce que j'ai compris des analyses factorielles c'est quand on cherche à caracteriser des individus par des variables. genre tel groupe d'athelete sont plus fort en saut et perche contrairement à l'autre groupe ....
Mais quand vous dites influencer, je pense à expliquer: qu'est ce qui explique l'apparition de ces espece en tenant compte des saison, temps, mois.... Et là on pense plutot à faire une regression adaptée à ce type de donnée.
Donc si vous pouvez eclairez davantage sur le resultat que vous voulez obtenir...?
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
Ah j'ai une autre idée.
Vous pouvez faire une ACP avec les variable quantitative (avec l'hypothese pour moi que c'est le nombre d'espece de cette ligne ) ensuite vous mettez en supplementaire les variables qualitatives et vous lisez parallelement le cercle de correlation et le graphe de la projection des individus pour dire que tel groupe d'espece est caracteriser par telles variables
Vous pouvez faire une ACP avec les variable quantitative (avec l'hypothese pour moi que c'est le nombre d'espece de cette ligne ) ensuite vous mettez en supplementaire les variables qualitatives et vous lisez parallelement le cercle de correlation et le graphe de la projection des individus pour dire que tel groupe d'espece est caracteriser par telles variables
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
Bonjour, merci de votre réponse
et du coup j'ai changé mon tableau qui ressemble à ça maintenant:
mois_decade temp pluie Azure_Nerpruns Belle-Dame Carte_geo
JAN_1 4.92 31.4 0 0 0
JAN_2 7.86 11.2 0 0 0
JAN_3 2.48 5.8 0 0 0
FEV_1 7.01 5.8 0 0 0
FEV_2 6.79 22 0 0 0
FEV_3 7.59 16.9 0 0 0
MAR_1 5.47 0 0 0 0
MAR_2 9.12 2.4 0 0 0
MAR_3 11.2 8.5 0 0 0
AV_1 13.8 1.8 0 0 1
AV_2 12.13 0 8 0 0
AV_3 15.34 8.1 7 0 0
MAI_1 15.1 16.6 15 0 6
Et donc j'ai fait des ACP et donc j'ai le graphe des corrélations et les obs des différents ind pour voir si c'est corrélé à la température et la pluviométrie.
Il me reste à voir pour les habitats ^^
et du coup j'ai changé mon tableau qui ressemble à ça maintenant:
mois_decade temp pluie Azure_Nerpruns Belle-Dame Carte_geo
JAN_1 4.92 31.4 0 0 0
JAN_2 7.86 11.2 0 0 0
JAN_3 2.48 5.8 0 0 0
FEV_1 7.01 5.8 0 0 0
FEV_2 6.79 22 0 0 0
FEV_3 7.59 16.9 0 0 0
MAR_1 5.47 0 0 0 0
MAR_2 9.12 2.4 0 0 0
MAR_3 11.2 8.5 0 0 0
AV_1 13.8 1.8 0 0 1
AV_2 12.13 0 8 0 0
AV_3 15.34 8.1 7 0 0
MAI_1 15.1 16.6 15 0 6
Et donc j'ai fait des ACP et donc j'ai le graphe des corrélations et les obs des différents ind pour voir si c'est corrélé à la température et la pluviométrie.
Il me reste à voir pour les habitats ^^
boubou- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 05/05/2014
Re: ACM ou ACP
mais petite question comment je pourrais faire pour faire l'ACP avec mes variables quantitatives et ajouter les qualitatives? c'est les mettre comme descriptives nan? comme la saison je ne vois pas comment faire :/
boubou- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 05/05/2014
Re: ACM ou ACP
en fait apres avoir fait on ACP avec les variables quantitatives, tu mets en supplementaire les variables qualitatives. sur SAS ya une option supplementary qui le permet, sur R je ne sais pas à quoi ça correspond dans pca ou dudi.pca.
regarde l'aide sur R avec ces fonctions pour voir
regarde l'aide sur R avec ces fonctions pour voir
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
J'ai trouvé ça:
http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pdf/qr8.pdf
http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pdf/qr8.pdf
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
oui j'ai vu mais je sais pas si c'est moi qui est vraiment nulle :/ mais je comprend pas grand chose et je ne vois pas comment faire...
boubou- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 05/05/2014
Re: ACM ou ACP
c'est quanti.supp
regarde ce lien c'est plus illustratif
http://factominer.free.fr/classical-methods/analyse-en-composantes-principales.html
regarde ce lien c'est plus illustratif
http://factominer.free.fr/classical-methods/analyse-en-composantes-principales.html
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
oupss pour ton cas: les saison et moi seront dans quali.supp si tavai des variable quantitatives qui etaient ecarté de l'analyse tu utiliserais quanti.supp
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
merci beaucoup le site est cool en effet. mais maintenant c'est de savoir comment je fais mon tableau car y a tellement de choses à mettre que du coup pas facile ou faut que je le fasse espèce par espèce :/ mais même pas j'aurais pas le même nombre de valeurs pour chaque colonne...
boubou- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 05/05/2014
Re: ACM ou ACP
finalement je crois que l'AFD (analyse en facteur discriminante) est mieux, car avec cette methode tu caracterise des var quali avec d'autre variable.
Essaie de voir en ce sens.
j'ai essayé de voir avec un acp puis faire une CHA (classification), mais le tableau pour le transformer a mon niveau c'est compliquer.
finalement je me demande est ce qu'on a pas fait fausse route. Peut être aussi l'ACM serait mieux que et tu met en supplementaire les variables quantitatives. Et eventuellement faire une CHA (Classification hierarchique ascendante)
Désolée.
Bonne chance
Essaie de voir en ce sens.
j'ai essayé de voir avec un acp puis faire une CHA (classification), mais le tableau pour le transformer a mon niveau c'est compliquer.
finalement je me demande est ce qu'on a pas fait fausse route. Peut être aussi l'ACM serait mieux que et tu met en supplementaire les variables quantitatives. Et eventuellement faire une CHA (Classification hierarchique ascendante)
Désolée.
Bonne chance
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
houla mais moi je connais pas tout ça :/
mais bon je vais essayer de chercher encore
merci beaucoup de ton aide en tout cas
mais bon je vais essayer de chercher encore
merci beaucoup de ton aide en tout cas
boubou- Nombre de messages : 8
Date d'inscription : 05/05/2014
Re: ACM ou ACP
sur le net tu trouvera des cours simple sur cela.
pas de quoi
pas de quoi
melanine- Nombre de messages : 21
Date d'inscription : 09/11/2013
Re: ACM ou ACP
Petite précision : les .supp sont les variables qui apparaîtront dans les graphiques mais qui n'auront pas d'impact sur la variabilité des axes. C'est comme si tu mettais ces variables de côté lors de ton analyse.
Plusieurs vidéos sont disponibles sur youtube, tapes "François Husson"
(il propose aussi la FAMD qui comprend tout type de variables)
Plusieurs vidéos sont disponibles sur youtube, tapes "François Husson"
(il propose aussi la FAMD qui comprend tout type de variables)
zezima- Nombre de messages : 939
Date d'inscription : 26/02/2013
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