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test de comparaison variabilité interspecies/intraspecies

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Message par henry_tournel Mar 15 Jan 2013 - 13:32

Bonjour,

Je travaille actuellement sur un jeu de données qui me pose quelques soucis.
Ce jeu de données est composé de variables quantitatives mesurées sur plusieurs essences (pin, sapin,....).
parmi ces données, il y 'a entre autres des mesures de photosynthèse telles la vitesse de carboxylation, ect..
Le but étant d'essayer de regrouper les essences selon certaines caractéristiques (pour cela je voudrais passer par de la classification hiérarchique).

J'essaye de trouver un moyen qui me permettrait de pouvoir comparer la variabilité intra-espèce et inter-espèces des mesures. Le but étant de savoir si ça vaut le coup d'essayer de regrouper ou non les essences (si la variabilité intra est plus grande que la variabilité inter ça ne vaut pas le coup).

J'ai essayé de passer par des tests de kruskall-wallis suivi (non paramétriques) d'un test de rang de Wilcoxon mais cela ne me renseigne pas vraiment sur les différences inter/intra espèces.

Si quelqu'un a une idée et peut m'aider je suis preneur !

HT


henry_tournel

Nombre de messages : 2
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Message par Nik Mar 15 Jan 2013 - 14:47

Bonjour,

C'est typiquement un cas d'analyse multivariée, sans doute de l'ACP normée si tes variables ont des gammes de variabilités très différentes.
Ensuite tu peux regarder l'ACP intra-classe et/ou inter-classe en utilisant l'espèce comme classe. Tu pourras facilement obtenir une quantification de la part de variabilité totale expliquée par les différences inter et intra espèces.

Nik

Nik

Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008

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Message par henry_tournel Mer 16 Jan 2013 - 8:31

Merci Nik, je vais jeter un coup d’œil à cette méthode.

HT

henry_tournel

Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 15/01/2013

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