Comparaison de 2 séries ordonnées

Bonjour, je voudrais comparer 2 séries de données. Chacune des 2 séries comportent 4 classes et il y a 3 valeurs par classe (répétition d'un dosage, l'erreur expérimentale a son importance). Important aussi: les classes sont ordonnés.

1ère série: classe 1: x1, x2,x3 classe 2: x4,x5,x6 classe 3: x7,x8,x9 classe 4: x10,x11,x12

2èsérie: classe 1: y1, y2,y3 classe 2: y4,y5,y6 classe 3: y7,y8,y9 classe 4: y10,y11,y12

Quand on compare 2 groupes sur une échelle ordinale divisée en classe, on fait un Mann et Whitney. Mais là, j'ai des répétitions par classe que je n'ai pas envie de moyenner car l'erreur expérimentale est importante et je veux qu'elle pèse sur le résultat.

On peut faire quand même un Mann et Whitney? Un autre test serait-il plus approprié?
Merci pour vos réponses.