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[Besoin d'aide] Passage de poissons
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[Besoin d'aide] Passage de poissons
Bonjour à tous !
Tout d'abord merci pour votre forum qui va je l'espère me permettre d'y voir un peu plus clair dans l'analyse de mon jeu de données
Ma problématique est la suivante :
Je cherche à expliquer un effectif de poissons ayant emprunté un dispositif de franchissement d'obstacle dans un cours d'eau. Ce nombre de poissons a été obtenu en les capturant à l'aide d'un filet situé à l'amont de l'obstacle, relevé tous les 2 jours. A chaque relève, j'ai également mesuré un certain nombre de paramètres concernant la physico-chimie de l'eau par exemple. Pour résumé, les variables sont pour chaque date de relève :
- Y : le nombre d'individus capturé (i.e. qui ont emprunté le dispositif) que je cherche à expliquer (variable quantitative)
- X1 : Conductivité de l'eau (variable quantitative)
- X2 : Température de l'eau (variable quantitative)
- X3 : Concentration en oxygène de l'eau (variable quantitative)
- X4 : Acidité de l'eau (variable quantitative)
- X5 : Débit à l'aval de l'obstacle (variable quantitative)
- X6 : Débit à l'amont de l'obstacle (variable quantitative)
- X7 : turbidité de l'eau (variable qualitative : nulle, faible, moyenne, forte)
- X8 : météo (variable qualitative : soleil, couvert, brouillard, pluie)
J'aimerais avoir votre avis sur le type d'analyse que je peux appliquer pour essayer de déterminer ce qui conditionne la remontée des poissons.
Je vous joins un fichier excel avec quelques lignes pour vous faire une idée des données. Dans ce dernier, il y a une ligne pour chaque individu (tous les poissons récupérés ont été identifiés, mesurés et pesés) mais je n'en tiens pas compte pour l'instant, c'est vraiment le nombre d'individus toutes espèces confondues qui sont récupérés à chaque relève qui m'intéresse dans un premier temps.
Merci
Tout d'abord merci pour votre forum qui va je l'espère me permettre d'y voir un peu plus clair dans l'analyse de mon jeu de données
Ma problématique est la suivante :
Je cherche à expliquer un effectif de poissons ayant emprunté un dispositif de franchissement d'obstacle dans un cours d'eau. Ce nombre de poissons a été obtenu en les capturant à l'aide d'un filet situé à l'amont de l'obstacle, relevé tous les 2 jours. A chaque relève, j'ai également mesuré un certain nombre de paramètres concernant la physico-chimie de l'eau par exemple. Pour résumé, les variables sont pour chaque date de relève :
- Y : le nombre d'individus capturé (i.e. qui ont emprunté le dispositif) que je cherche à expliquer (variable quantitative)
- X1 : Conductivité de l'eau (variable quantitative)
- X2 : Température de l'eau (variable quantitative)
- X3 : Concentration en oxygène de l'eau (variable quantitative)
- X4 : Acidité de l'eau (variable quantitative)
- X5 : Débit à l'aval de l'obstacle (variable quantitative)
- X6 : Débit à l'amont de l'obstacle (variable quantitative)
- X7 : turbidité de l'eau (variable qualitative : nulle, faible, moyenne, forte)
- X8 : météo (variable qualitative : soleil, couvert, brouillard, pluie)
J'aimerais avoir votre avis sur le type d'analyse que je peux appliquer pour essayer de déterminer ce qui conditionne la remontée des poissons.
Je vous joins un fichier excel avec quelques lignes pour vous faire une idée des données. Dans ce dernier, il y a une ligne pour chaque individu (tous les poissons récupérés ont été identifiés, mesurés et pesés) mais je n'en tiens pas compte pour l'instant, c'est vraiment le nombre d'individus toutes espèces confondues qui sont récupérés à chaque relève qui m'intéresse dans un premier temps.
Merci
- Fichiers joints
Dernière édition par petitpecheur le Mar 3 Juil 2018 - 15:10, édité 1 fois
petitpecheur- Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 03/07/2018
Re: [Besoin d'aide] Passage de poissons
Bonjour,
D'un point de vue stat, tu peux t'orienter vers un modèle linéaire généralisé (GLM) avec erreur de type Poisson(car tu as un effectif). Ce n'est pas une analyse simple et il est possible que tu te retrouves avec des phénomène d'auto-corrélation dans ton jeu de données.
Si tu ne matrise pas les GLM, sache que l'apprentissage peu être un peu long.
Plus spécifiquement sur l'efficacité d'une passe à poisson, il ne faut pas utiliser les variables explicatives (débit, t°...) telle que, car en général les individus franchissent l'ouvrage en fonction des conditions des qqs jours précédents et pas ce qui se passe exactement le jour même. Il faut donc lagger les données.
reviens vers nous en cas de question.
Nik
D'un point de vue stat, tu peux t'orienter vers un modèle linéaire généralisé (GLM) avec erreur de type Poisson(car tu as un effectif). Ce n'est pas une analyse simple et il est possible que tu te retrouves avec des phénomène d'auto-corrélation dans ton jeu de données.
Si tu ne matrise pas les GLM, sache que l'apprentissage peu être un peu long.
Plus spécifiquement sur l'efficacité d'une passe à poisson, il ne faut pas utiliser les variables explicatives (débit, t°...) telle que, car en général les individus franchissent l'ouvrage en fonction des conditions des qqs jours précédents et pas ce qui se passe exactement le jour même. Il faut donc lagger les données.
reviens vers nous en cas de question.
Nik
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
Re: [Besoin d'aide] Passage de poissons
Yes, je pensais sérieusement au GLM.
Et oui faudrait que je fasse mon analyse d'effectif avec les mesures physico de la relève précédente, voire celles d'avant. C'est quelque chose que j'ai déjà fait sur d'autres analyses.
J'vais tenter de me lancer et commencer par vérifier la structure de mes régresseurs. Puis je crois me souvenir qu'en passant par une version orthogonalisée avec une ACP... hmmm j'vais me renseigner.
Merci beaucoup de ta réponse en tout cas. Si jamais t'as une référence de bouquin ou quoi que ce soit qui pourrait m'aider à dompter les glm je suis preneur
Quentin
Et oui faudrait que je fasse mon analyse d'effectif avec les mesures physico de la relève précédente, voire celles d'avant. C'est quelque chose que j'ai déjà fait sur d'autres analyses.
J'vais tenter de me lancer et commencer par vérifier la structure de mes régresseurs. Puis je crois me souvenir qu'en passant par une version orthogonalisée avec une ACP... hmmm j'vais me renseigner.
Merci beaucoup de ta réponse en tout cas. Si jamais t'as une référence de bouquin ou quoi que ce soit qui pourrait m'aider à dompter les glm je suis preneur
Quentin
petitpecheur- Nombre de messages : 2
Date d'inscription : 03/07/2018
Re: [Besoin d'aide] Passage de poissons
Si les moyennes des nombres de poissons comptés sont élevées (disons supérieure à 30), alors les distributions de Poisson vont rapidement converger vers des lois normales et vous pouvez alors tranquillement partir sur des modèles linéaires standard (par exemple, régression multiple). Ca vous simplifierait la vie..
HTH, Eric.
HTH, Eric.
Eric Wajnberg- Nombre de messages : 1237
Date d'inscription : 14/09/2012
Re: [Besoin d'aide] Passage de poissons
Effecitvement si on peut passer par un modèle Gaussien alors c bien plus facile mais mon expérience en la matière m'a plutôt montré qu'on se retrouve surtout avec des problèmes d'hétéroscédasticité pour lesquels le modèle Gaussien est peu adapté.
@Quentin
Pour la référence, the must reste McCullagh & Nelder "Generalized Linear Models".
@Quentin
Pour la référence, the must reste McCullagh & Nelder "Generalized Linear Models".
Nik- Nombre de messages : 1606
Date d'inscription : 23/05/2008
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