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Aide stats étude cross over

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Aide stats étude cross over

Message par Hehe le Jeu 14 Juin 2018 - 23:46

Bonjour,

Dans le cadre de mon mémoire j'ai réalisé une étude au cours de laquelle j'évaluais le nombre de selles hebdomadaires.

Mon panel étant de 16 sujets, je les ai divisés en 2 groupe

Le groupe 1 a suivi le modem suivant :
-> Semaine 1 = Semaine témoin sans traitement
-> Semaine 2 = Semaine avec traitement
-> Semaine 3 = Semaine avec traitement
-> Semaine 4 = Semaine sans rien
-> Semaine 5 = Semaine avec placebo
-> Semaine 6 = Semaine avec placebo

Le groupe 2 a suivi le modem suivant :
-> Semaine 1 = Semaine témoin sans traitement
-> Semaine 2 = Semaine avec placebo
-> Semaine 3 = Semaine avec placebo
-> Semaine 4 = Semaine sans rien
-> Semaine 5 = Semaine avec traitement
-> Semaine 6 = Semaine avec traitement

Je fonctionne donc en cross over si je dis pas de bêtise. Le souci c'est qu'on attend de moi des résultats avec une/des puissance statistique que je ne sais absolument calculer...
Pourriez vous mi'ndiquez quel logiciel/site utiliser, la méthode et comment ?

Merci par avance de votre aide

Hehe

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Re: Aide stats étude cross over

Message par c@ssoulet le Ven 15 Juin 2018 - 7:00

Normalement, la puissance se calcule avant (pour définir l'effectif). Il y a pas mal de littérature sur les calculs de puissance après avoir fait un test d'hypothèse, au final l'interêt reste assez controversé.

Sinon j'ai un add-on stata qui fait ce calcul: xsampsi. Ci dessous une sortie de résultats, surtout pour avoir la référence.

. xsampsi, alpha(0.05) beta(0.1) delta(0.82) stddev(0.86)
Sample size for cross-over trial (AB/BA)
according to Senn 1991: 'Cross-over trials in clinical research'
Parameters below expressed in terms of the basic estimator, the treatment contrast.
---------------

Alpha level = 0.050 Power = 0.900
Zalpha = 1.960 Zbeta = 1.282

Detectable effect size = 0.820
Std.dev. of basic estimator = 0.860

Approximate N (normal) = 12
Critical value of t(df=10,0.025) = 2.228
Noncentrality parameter of t = 3.303
Power given approximate N above = 0.845


c@ssoulet

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Re: Aide stats étude cross over

Message par Hehe le Ven 15 Juin 2018 - 10:28

Euh ok... Je vous avoue que j'y comprends pas grand chose... Du coup selon vous il aurait fallu que j'ai plus de sujets ? ou c'est suffisant ?

Et au risque d'abuser, est ce que si je vous transmets mes résultats vous pourriez m'aider à obtenir les stats qui me permettrait de d'analyser mes résultats  ?
Pardon mais je n'y comprends vraiment rien

Hehe

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Re: Aide stats étude cross over

Message par Hehe le Ven 15 Juin 2018 - 12:08

P1    P2    P3   P4     P5     P6    P7    P8
J7       2     2      3     1      1       2      2      1  Résultats après semaine témoin
J14     3     5      5     4      4       4      3      5  Résultats après semaine avec traitement
J21     4     3      6     4      3       3      4      3  Résultats après semaine avec traitement
J28     1     2      3     3      1       1      2      2  Résultats après semaine sans rien
J35     2     2      4     2      3       2      2      3  Résultats après semaine placebo
J42     1     1      3     2      3       2      1      4  Résultats après semaine placebo



        P1    P2    P3   P4     P5     P6    P7    P8
J7       1     2      2     1      1       1      2      2  Résultats après semaine témoin
J14     1     3      2     2      4       2      2      3  Résultats après semaine placebo
J21     2     2      2     3      3       1      1      2  Résultats après semaine placebo
J28     1     2      2     2      2       2      2      1  Résultats après semaine sans rien
J35     3     4      2     5      3       5      2      4  Résultats après semaine avec traitement
J42     3     4      3     4      5       5      3      5  Résultats après semaine avec traitement

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Re: Aide stats étude cross over

Message par c@ssoulet le Ven 15 Juin 2018 - 13:07

je ne pense rien du tout, je te donne un exemple de logiciel qui fait le calcul (calculer un nombre de sujets ou une puissance c'est exactement la même chose) et une référence à aller lire si tu veux avoir des précisons.

Après, à toi de jouer.

c@ssoulet

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Re: Aide stats étude cross over

Message par Hehe le Ven 15 Juin 2018 - 13:23

Oui d'accord mais si maintenant je cherche a obtenir la p-valeur, le logiciel m'indiquera aussi quelle stat utiliser ? J'arrive pas à savoir si je dois fonctionner avec le student test ou un autre...
Je suis désolée mais je comprends vraiment rien.

Hehe

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Re: Aide stats étude cross over

Message par c@ssoulet le Ven 15 Juin 2018 - 13:34

Aucun logiciel ne te diras jamais quel test effectuer.

Tu as posé une question sur la puissance, je te donne une solution pour calculer la puissance.
Tu demandes quel test appliquer, je ne peux pas te répondre. Pour choisir le bon test, il faut avoir un minimum de connaissances en stats, parfaitement connaître les détails de l'expérimentation (jeter un coup d'œil à un tableau de chiffres est loin d'etre suffisant) et faire un peu fonctionner sa cervelle.

Tout ca prend beaucoup de temps, et n'est pas faisable sur un forum. Donc si tu n'y connais vraiment rien, il va falloir que tu trouves quelqu'un.

Tu parles de traitement et d'expérimentation. Donc tu interprètes un essai clinique. Il existe quelque part un protocole. Sur ce protocole, il y a le nom du méthodologiste (du statisticien) qui a participé à son écriture. C'est la personne compétente que tu dois contacter.

c@ssoulet

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