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Biostatgv

Message par Thésard le Ven 20 Avr 2018 - 19:10

Bonjour,
je cherche à savoir si la différence d'une variable observée entre 2 groupes de personnes est significative ou non, j'utilise le site internet Biostatgv pour cela, avec le test de Fisher. Mes données sont les suivantes :

                                         
tableau                                 Crohn       RCH
Cancer Dépisté                       6           15
Cancer non dépisté                  4           3
total                                     10        18

Je veux savoir si la proportion de cancers non dépistés chez les Crohn (40%) est significativement plus élevée que celle dans le groupe de patients RCH (16.7%)
Pour ceux qui connaissent BiostaTGV, que dois-je saisir dans le tableau de contingence ?
6 ; 15
4 ; 3 ?

ou bien

4 ; 3
10 ; 18 ?

ou autre ?

Merci pour votre aide Wink

Thésard

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Re: Biostatgv

Message par Eric Wajnberg le Sam 21 Avr 2018 - 6:06

Vous devez rentrer

6 ; 15
4 ; 3

C'est-à-dire rentrer la table de contingence. Et on ne trouve aucune différence significative.

HTH, Eric.
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Re: Biostatgv

Message par Thésard le Dim 22 Avr 2018 - 14:25

Merci pour votre réponse, effectivement ll n'y a pas de différence significative.

Si je veux savoir si il existe une différence significative sur un critère donné entre les effectifs de mon étude et ceux d'un autre groupe que dois-je saisir ?
je m'explique: dans mon étude 6 de mes 20 patients ont un cancer muté, dans la population générale 40% des patients ont un cancer muté, si je veux savoir si l y a une différence significative, je dois taper dans le tableau de contingence :
6 ; 20
4 ; 6 ? (soit les 40% de la population générale)
ou dois-je veiller à ce que le nombre des effectifs soient les mêmes (càd avoir un total de 26 dans chaque groupe)? donc plutôt
6 ; 20
10.4 ; 15.6 ?

(j'ai constater que la p-value est complètement différente en fonction de l'une ou l'autre alternative, ce qui me parait logique vu que la taille des effectifs est différente)

Merci Wink

Thésard

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Re: Biostatgv

Message par Eric Wajnberg le Lun 23 Avr 2018 - 5:32

Npn, vous ne devez pas necessairement avoir les mêmes effectifs. C'est une comparaison de pourcentage que vous faite.

De plus, la table est une table de contingence. Par définition, ce sont des entiers qui la composent (pas de valeurs décimales).

Le première table est la bonne.

Et oui, les p-values changent, évidement, en fonction des effectifs.

Tous ceci représente des notions de base en statistique, que nous ne pouvez pas deviner/inviter. Je pense que vous devriez vous documenter (suivre des cours, lire des ouvrages, vous balader sur le web, etc.), sans quoi vous ne pourrez pas vous en sortir.

Eric.
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