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wilcoxon  valeurs négatives Empty wilcoxon valeurs négatives

Message par LILOUFB le Sam 14 Avr 2018 - 13:44

Bonjour,
Je viens vers vous car je souhaite faire un test wilcoxon sur l'impact d'une variable catégorielle (AP.LOCUS.CI) sur des variables dont les valeurs sont négatives et positives (DIF.TRIG ; DIFF.HBA....)
J'ai fais cette ligne de code pour faire cela sur la première variable (DIF.TRIG) :
Code:
wilcox.test(data2$DIF.TRIG, data2$AP.LOCUS.CI)

mais j'ai ce message d'erreur :
Code:
Error in wilcox.test.default(data2$DIF.TRIG, data2$AP.LOCUS.CI) :
  'x' doit être numérique

Je me demandais si cette erreur était liée au fait qu'il y a des valeurs négatives ? Comment résoudre ce problème ?

Merci d'avance !

Voici mon jeu de données :

Code:
AP.LOCUS.CI Age DIF.TRIG DIFF.HBA DIFF.TDT DIFF.LDL DIFF.PSY.100 DIFF.ENV.100
1     1      faible  45    -0.17    -0.17        1     0.13            0           -7
2     2      faible  54     0.16     0.16       -1     0.31          -13            0
3     3      faible  62    -0.19    -0.19      -18    -0.19            6          -12
5     5        fort  67     0.17     0.17        5      0.7           25           12
6     6        fort  69    -0.14    -0.14       -3    -0.51          -31          -19
7     7        fort  64     0.07     0.07       -8     -0.3            0            0
8     8        fort  46     1.79     1.79       -3     0.22           -7            6
11   11        fort  66    -0.85    -0.85       -2    -2.52          -13           -6
12   12      faible  62     0.01     0.01     -4.5    -0.09          -12           13
13   13        fort  75     0.37     0.37        2     0.05            0          -13
14   14        fort  58     -1.6     -1.6        5    -0.22          -13            7
17   17        fort  57    -0.13    -0.13       14     0.11            0            0
18   18      faible  52    -0.06    -0.06       -1    -0.44            0            6
19   19        fort  64    -1.69    -1.69        1    -0.54            6            0
20   20        fort  67        0        0        0    -0.08           12          -19
21   21        fort  61    -1.62    -1.62       -8    -0.39            7           -7
24   24      faible  75     0.67     0.67       -4     0.03            0            0
25   25        fort  73     0.33     0.33       -3    -0.09          -19          -25
26   26        fort  49    -0.08    -0.08        0      0.2            0           13
27   27      faible  51     0.47     0.47       -1     0.08          -13          -31
28   28        fort  61     0.07     0.07        0     -0.1           -7           -6
29   29      faible   3    -0.26    -0.26      -12    -0.33            6           25
30   30      faible  69     0.63     0.63       -1    -0.05           13            0
31   31      faible  80     -0.1     -0.1        0     0.12            6           19
32   32        fort  60    -0.17    -0.17        1     0.01           -6            6
33   33        fort  67     -0.8     -0.8      -10    -0.14            6           -6
34   34      faible  56    -0.28    -0.28       -4     -0.4          -31           -6
35   35        fort  68     0.06     0.06       -3    -0.24            7            0
36   36      faible  81     0.25     0.25        0    -0.85          -31           -6
37   37        fort  74     0.24     0.24        3    -0.05          -19            0
38   38        fort  52     0.14     0.14        4    -0.24           12           -7
40   40        fort  73    -0.28    -0.28       -9     0.18           -6           12
41   41      faible  71     0.39     0.39       -4    -0.08           -6            0
44   44        fort  55     -0.4     -0.4       -3    -0.37            0            6
47   47        fort  57    -0.77    -0.77        0    -0.56           -6            6
49   49        fort  56     0.02     0.02       -1    -0.22           -7            0
50   50        fort  68     0.84     0.84        1     -0.5            7           -7
51   51        fort  65    -0.27    -0.27       -5     0.27           19           12
52   52        fort  59     0.09     0.09       -4     0.06           19            6
54   54        fort  78     0.72     0.72      -10     0.16            0            0
55   55        fort  67    -1.32    -1.32        2    -0.11           -6            6
57   57        fort  51     0.07     0.07        5    -0.58            6            6
60   60        fort  68     0.48     0.48       -2        0          -12           -6
61   61        fort  70     0.35     0.35       -3     0.59           12           -6
62   62        fort  74    -0.88    -0.88       -9    -0.02           25           25
63   63      faible  72     1.33     1.33        1    -0.06           -6          -12
64   64        fort   2    -0.05    -0.05        0    -0.13           -6           -6
66   66      faible  77     1.01     1.01       -4     0.46           -6            0
67   67      faible  60    -0.51    -0.51       -7     0.04           12           13
70   70        fort  52     1.11     1.11        1    -0.31            7           13
72   72      faible  66    -0.97    -0.97        0    -0.08           25           -6
73   73        fort  67     0.42     0.42        3     0.34           18           12
76   76        fort  65     0.34     0.34       -2    -0.17           12           12
77   77        fort  59    -0.17    -0.17        0     0.13          -32          -25
78   78      faible  63     1.73     1.73       -6    -0.02          -12           13
80   80      faible  50     0.16     0.16        6    -0.42            6           -6
81   81        fort  49     -0.4     -0.4       -6    -0.23          -18            7
82   82      faible  61     0.62     0.62       -2      0.8            0            6
83   83        fort  68     0.08     0.08        2     0.19           13            0
85   85        fort  81     0.42     0.42       -4    -0.14            0           -7
86   86        fort  70     -0.4     -0.4       -6    -0.09            6           12
88   88        fort  68     0.11     0.11       -3    -0.05            6            7

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Message par Eric Wajnberg le Sam 14 Avr 2018 - 16:19

Aucun problème pour avoir des valeurs négatives, mais vous utilisez wilcox.text() avec une syntaxe erronée.

Dans votre cas, vous devez lancer :

Code:
wilcox.test(data2$DIF.TRIG~data2$AP.LOCUS.CI)
Ce n'est pas ce que vous faites.

HTH, Eric.
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Message par LILOUFB le Dim 15 Avr 2018 - 17:33

Bonjour,
Merci beaucoup pour votre réponse mais en suivant vos conseils j'ai de nouveau un message d'erreur
Code:
> wilcox.test(data2$DIF.TRIG~data2$AP.LOCUS.CI)
Error in wilcox.test.default(x = c(7L, 39L, 8L, 31L, 2L, 54L, 50L, 9L,  :
  'x' doit être numérique

LILOUFB

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Message par Ayana le Dim 15 Avr 2018 - 17:42

Bonjour,

Il y a du y avoir un probleme d'import de format, et la variable DIF.TRIG est probablement codee comme un facteur (ce que tu peux verifier en faisant un summary de ta table).
Si c'est le cas, un simple recodage suffit:
Code:
data2$DIF.TRIG<-as.numeric(as.character(data2$DIF.TRIG))

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Message par LILOUFB le Dim 15 Avr 2018 - 18:00

Super ça marche !! Merci Very Happy

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