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Que compare un test de contraste ?

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Message par zezima le Ven 2 Mar 2018 - 15:30

Bonjour,

Je suis actuellement en train de travailler sur une méthode de tests de contrastes (MCPMod) pour comparer des effets en fonction de plusieurs doses.

Imaginons que nous avons 6 groupes de doses 0, 0.1, 1, 10, 100, 1000.

Il existe des contrastes simples :
(-1 1 0 0 0 0) qui va comparer la première moyenne avec la deuxième moyenne
(-1 -1 -1 1 1 1) qui va comparer la moyenne des 3 premiers groupes à la moyenne des 3 derniers groupes
(-5 1 1 1 1 1) qui va comparer le premier groupe à tous les autres groupes (i.e. la moyenne du premier groupe est-elle différente de l'une des 5 autres moyennes)

Je ne sais pas si je me suis trompé jusque ici dans les 3 premiers exemples mais là où ça se complique, c'est lorsqu'on applique le MCPMod.
Le MCPMod va choisir des contrastes en fonction de différents modèles pré-sélectionnés.

Par exemple pour un modèle Emax (concave), le MCPMod propose un contraste :
dose0 : 0.38
dose0.1 : 0.35
dose1 : 0.20
dose10 : -0.05
dose100 : -0.39
dose1000 : -0.49

Est-ce juste de dire que le contraste compare la moyenne pondérée 0.38*mean0+0.35*dose0.1+0.2*dose1 à la moyenne pondérée 0.05*dose10+0.39*dose100+0.49*dose1000 ?
Si le test sort significatif, on peut "conclure" entre guillemets que l'estimate de la différence entre la première moyenne pondérée et la seconde moyenne pondérée est significativement différent de 0 ?

Je peux rentrer dans les précisions si ce n'est pas clair du tout.

Merci d'avance
zezima
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Message par Eric Wajnberg le Sam 3 Mar 2018 - 9:09

Un contraste n'est rien d'autre qu'une combinaison linéaire des effets moyens avec les pondérations que tu donnes dans tes exemples. Le test de ce contraste compare la moyenne de cette combinaison linéaire à zéro. C'est aussi simple que ça.

Donc je pense que tes interprétations sont correctes, et on peut construire les contrastes que l'on veut.

HTH, Eric.
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Message par zezima le Lun 5 Mar 2018 - 8:01

Merci pour ta réponse, ça répond à mes interrogations.

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