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quel test faire?

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quel test faire?

Message par Zann'su le Ven 8 Sep 2017 - 13:55

Bonjour,

Je suis statophobe et pourtant j'ai des obligations d'en faire pour mon boulot... Je viens vers vous pour savoir quel test vous feriez à ma place et comment le réaliser sur R.

Nous avons contrôlé sur 3 années la ploïdie de 25 lots de crevettes. Selon les années et les lots les effectifs ne sont pas les mêmes.

En 2014, il s’est avéré que 1 sur 25 lots présentait de fortes incohérences entre la ploïdie attendue et la ploïdie réelle, mais l’effectif d’échantillonnage n’était que de 10 individus par lot.

En 2015 et 2016, nous les avons contrôlé de nouveau et beaucoup plus de lots ont montré des incohérences. Cependant l’effectif par lot était bien plus élevé.

Y a –t-il possibilité de démontrer qu’il existe une hétérogénéité des résultats et que le peu d’incohérence rencontré en 2014 est dû au faible effort d’échantillonnage ? Si oui quel est le test à réaliser ?

Voici en pièce jointe le tableau présentant nos résultats :
Fichiers joints
incoherence.xlsx Vous n'avez pas la permission de télécharger les fichiers joints.(11 Ko) Téléchargé 2 fois

Zann'su

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Re: quel test faire?

Message par zezima le Lun 11 Sep 2017 - 8:05

Bonjour,

Ce dont tu parles ressemble à du monitoring de tes données.

Tu peux monitorer tes données directement ou en utilisant des méthodes statistiques (CSM=Central Statistical Monitoring).

L'information que tu veux traduire est : "est-ce que mon lot a un pourcentage d'incohérence trop extrême par rapport aux autres lots ?".

C'est le principe du CSM, dans lequel tu compares chaque groupe en fonction des autres groupes afin de vérifier qu'ils n'ont pas des valeurs extrêmes (=outliers).

Comme technique du CSM permettant de répondre à cette question, tu as le Volcano plot (où chaque point correspond à un lot) qui te permettra d'afficher les lots qui ressortent extrêmes. Son avantage est que tu pourras choisir des seuils pour afficher les lots sortant les plus extrêmes (afin qu'il ne te sortent pas trop de lots au hasard).
Il y a également le Funnel plot qui est plus compliqué à mettre en place et plus compliqué d'interprétation.
Les deux techniques sont assez équivalentes.
Il existe bien sûr plein d'autres méthodes mais ces deux là sont assez visuelles.

Tu peux également essayer de lancer une méthode globalement (toutes années confondues) et pour chaque année (un volcano plot pour l'année 2014, un pour l'année 2015, etc...)


Dernière édition par zezima le Lun 11 Sep 2017 - 8:05, édité 1 fois (Raison : CSM def)
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