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Interprétation test du Chi2 et test Anova

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Interprétation test du Chi2 et test Anova

Message par MarionL le Lun 21 Aoû 2017 - 14:47

Bonjour,

J'ai réalisé plusieurs test sur 100 nichoirs à oiseaux dont 50 occupés et 50 non-occupés. J'avais plus plusieurs variables à tester (Année de pose, essence de l'arbre et type de nichoir) sur ces occupations afin de voir s'il existait des liens entre ces variables et ces occupations. Pour cela, j'ai réalisé des tests du Chi2 et des tests de Fisher. J'ai obtenu les résultats suivants:

Pose/Occupation:

                 2015     2016    2017
occup            11         15        24
nonoccup       14         16        20

p-value=0.6853

Nichoir/Occupation

                 Polyvalent    Gobemouche
occup               50                0
nonoccup          45                5

p-value=0.05628

Essence/Occupation

                    Aub  Aul  Che  Cyp  Era  fre  Niden  Peu  Pin  Rob  Sau
occup               1     0     12    2     1     7      1       5    18    3      0
nonoccup          1     1     17    2     0     5      0       8    10    5      1  

p-value=0.5666

On est donc d'accord que H0 est vraie et donc qu'il n'existe pas de lien entre mes variables et l'occupation ?
Donc si je prends mes variables une par une avec l'occupation, il n'y a pas de lien mais peut-être quand prenant plusieurs variables en même temps, il pourrait y avoir un lien qui se dégage ? Existe-t-il un test pour le vérifier ?

Ensuite pour mes 100 nichoirs, j'ai calculé en m² la surface de différents type de sol (Vigne, Culture, Haie, Foret, Eau, Pelouse, Friche, Urbain). Cela m'a donnée un tableau de 100 lignes et 8 colonnes ci-joint, mais pour simplifier mon test j'ai calculé l'aire totale pour les cultures des nichoirs occupés et non occupés. Et ainsi de suite :  

                culture   eau  vigne  haie pelouse urbain foret        friche
occupé        9688303 2832243 18160372 927882 1929549 2548281 2058112 310675
non occupé 8389226 3266859 18658108 1006967 906591 3215146 2508154 379623

Je voudrais donc tester si l'aire de mes milieux avaient une influence sur l'occupation de mes nichoirs. Dois-je réaliser un test du chi2 ou une anova ?

Merci beaucoup pour votre aide !
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MarionL

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Re: Interprétation test du Chi2 et test Anova

Message par Eric Wajnberg le Lun 21 Aoû 2017 - 15:47

Vous êtes classiquement dans un problème qui se résout avec une régression logistique. C'est comme une ANOVA, mais la variable à expliquer est un pourcentage. Vous pouvez mettre dedans toutes les variables explicatives que vous voulez, i.e., année de pose, essence de l'arbre, type de nichoir, aire des milieux, etc., et y compris les interactions entre ces variables que vous loupez en les prenant séparément.

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Re: Interprétation test du Chi2 et test Anova

Message par MarionL le Lun 21 Aoû 2017 - 16:28

Merci pour la réponse !

Je ne connais pas du tout ce type de test. On peut y mettre autant des variables qualitatives et quantitatives ?
Et je pourrais expliquer mes occupations en fonction de mes différentes variables ?
Sous quelle forme doit être mon tableau ? Sachant que je travaille sur R

Merci !

MarionL

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Re: Interprétation test du Chi2 et test Anova

Message par Eric Wajnberg le Lun 21 Aoû 2017 - 17:56

Oui, à la première question. Oui, à la seconde.

Dans R, comme dans tous les logiciels que je connaisse, les individus doivent être en ligne, et toutes les variables en colonne.

La régression logistique est abondement documentée sur le web, avec des exemples, etc.

HTH, Eric.
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