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ACP en R avec le package FactorMineR

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ACP en R avec le package FactorMineR

Message par Yuurei007 le Lun 14 Aoû 2017 - 20:44

Bonjour,

Disons que je réalise une ACP avec la fonction PCA du package FactorMineR.
En l'appliquant sur une base de données d'apprentissage, j'obtiens un objet R comportant entre autres :
- les valeurs propres
- les coordonnées des variables dans la nouvelle base des facteurs de l'ACP
- les coordonnées des individus dans la nouvelle base des facteurs de l'ACP

Y a t-il un moyen, à partir des données citées plus haut (a priori à partir des deux premières) d'être capable de calculer pour une nouvelle observation (voire une des observations utilisées dans la base d'apprentissage) les coordonnées des individus dans la base des facteurs (celle qui a été construite avec la base d'apprentissage) sans avoir à refaire une ACP ?

Merci d'avance.

Yuurei007

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Re: ACP en R avec le package FactorMineR

Message par droopy le Mer 16 Aoû 2017 - 7:55

Bonjour,

Avec FactoMineR tu peux spécifier dans la fonction PCA que tu as des individus supplémentaires, qui ne seront pas pris en compte dans l'ACP mais pour lesquels tu pourras avoir les coordonnées en fonction des cordonnées des variables établis à partir des autres individus :
Code:
# un exemple avce un jeu de données
data(meaudret, package = "ade4")
tab <- meaudret$env
# on ne prend pas en compte le 12ème individu dans l'ACP
acp1 <- PCA(tab, ncp = 2, ind.sup = 12)
# les résultats de cet individu sont stockés dans $ind.sup
acp1$ind.sup
$coord
        Dim.1    Dim.2
au_2 9.131472 -0.654386

$cos2
        Dim.1      Dim.2
au_2 0.8073029 0.004145938

$dist
    au_2
10.16301
# pour les coordonnées de cet individu en fonction des coordonnées des variables de l'ACP :
acp1$ind.sup$coord
# pour tous les autres individus :
acp1$ind$coord
Cdlt
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droopy

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Re: ACP en R avec le package FactorMineR

Message par Yuurei007 le Mer 16 Aoû 2017 - 11:07

Bonjour Droopy,

Merci pour ta réponse. En effet, je suis un peu bête de ne pas y avoir pensé.

En plus, j'ai même dans le code de la fonction PCA, la manière de calculer ces coordonnées, si je veux le faire indépendamment.

Merci de m'avoir débloqué.

Yuurei007

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