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ANOVA vs Tukey

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ANOVA vs Tukey

Message par Tomy le Jeu 6 Juil 2017 - 13:42

Bonjour à tous,

C'ets la première fois que je pose une question sur un forum de stat et n'étant pas une lumière en stat, pardonnez mon ignorance.

Voila mon problème vient de l'interprétation de mes tests stats car l'anova 2 facteurs et le test de Tukey ne me sortent pas les même conclusions. Or les résultats du test de Tukey me semblent plus proche de la réalité que l'ANOVA mais peut-on tenir compte avantage des résultats produit pour un Tukey par rapport à une Anova alors que c'est un test a posteriori qui découle justement de cette même ANOVA ?

Je test l'effet du nickel et de l'urée sur la physiologie corallienne... et par exemple dans un de mes jeux de données, l'anova me donne ça :
Gross photosynthesis SS dfF-ratio p-Values
Nickel 1.922 1 16.719 0.003**
Urea 1.129 1 9.820 0.014*
Nickel x Urea 0.393 1 3.419 0.102
Error 0.920 20


J'en déduis donc qu'il existe un effet du nickel seul et de l'urée seul mais qu'il n'y pas d'interactions... oui sauf que quand je réalise le tukey test j'obtiens cela :

diff lwr upr p adj
Sans:Avec-Avec:Avec -1.1624405 -2.0490114 -0.27586965 0.0127849*
Avec:Sans-Avec:Avec -0.9754491 -1.8620200 -0.08887824 0.0319205*
Sans:Sans-Avec:Avec -1.4139079 -2.3004788 -0.52733704 0.0040613**
Avec:Sans-Sans:Avec 0.1869914 -0.6995795 1.07356228 0.9035216
Sans:Sans-Sans:Avec -0.2514674 -1.1380383 0.63510349 0.8012445
Sans:Sans-Avec:Sans -0.4384588 -1.3250297 0.44811208 0.4378728

La condition Avec:Avec représente la condition "interaction" et d'après le test de Tukey, c'est la seule condition qui significativement différente des autres donc visiblement il y a un effet de l'interaction qui n'est pas détecté par l'ANOVA...

Ce n'est pas la première fois que je rencontre ce genre de dilemme mais du coup, comment dois je interpréter cela ? Puis m'appuyer plus sur le tukey que sur l'ANOVA malgré l'absence d'interaction significative chez l'anova ? Dois je envisager d'autres tests ?

Merci beaucoup pour votre aide,
Tom
PS : si plus d'information sur mon expérience genre le design expérimental sont nécessaires alors n'hésitez pas mais ma question repose surtout sur la façon d'interpréter ce genre de résultats. J'espère que j'ai été clair

Tomy

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Re: ANOVA vs Tukey

Message par Tomy le Ven 7 Juil 2017 - 6:51

Personne pour m'aider ? Sad

Tomy

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Re: ANOVA vs Tukey

Message par Coco le Ven 7 Juil 2017 - 7:35

Salut,

Il me semble que pour l'ANOVA quand tu cherches à voir s'il y a une interaction entre les variables, tu ne dois plus les prendre en compte séparément mais uniquement l'interaction. Et donc dans ton cas, il n'y a pas significativité.
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Coco

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Re: ANOVA vs Tukey

Message par Tomy le Ven 7 Juil 2017 - 9:00

En effet, je suis bien d'accord sur le fait que l'ANOVA ne donne aucune significativité à l'interaction. Malgré cela, si l'on fait un tukey test à la suite de l'ANOVA alors on remarque que le seul aquarium qui présente des différences significatives avec les autres est l'aquarium contenant justement les conditions "croisées" (avec du nickel et avec de l'urée).
Et c'est justement cette contradiction entre ANOVA et test de tukey qui me pose problème dans l'interprétation..

Tomy

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Re: ANOVA vs Tukey

Message par c@ssoulet le Ven 7 Juil 2017 - 13:52

Le test de Tukey est un test post-hoc. C'est à dire qu'il n'a de sens que pour aller "préciser" ou se trouve l'interaction

Si l'interaction est non significative sur le test principal, ca n'a pas de sens de faire un post-hoc. Je ne vais pas te faire un roman sur les comparaisons 2 à 2 (puissance, sous populations et hypothèses différentes, maitrise de la hausse de l'erreur de première espèce.. etc..), il y a beaucoup de littérature là dessus. Mais tu es en train de faire une grosse salade pour rien.

c@ssoulet

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