Cox proportional Hazard model et newton-raphson

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Cox proportional Hazard model et newton-raphson

Message par joyeux_lapin13 le Mar 6 Déc 2016 - 7:44

Bonjour,

Quelqu'un aurait-il le code pour l'estimation des paramètres via l'algorithme itératif du gradient de Newton-Raphson dans le cas du modèle de Cox?

Où alors le code qui permet de calculer les différentes dérivées nécessaires? A partir de là je devrais pas galérer car j'ai déjà implémenter Newton-Raphson pour la régression logistique.

Merci d'avance.
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Re: Cox proportional Hazard model et newton-raphson

Message par Eric Wajnberg le Mar 6 Déc 2016 - 10:27

La question n'est pas totalement claire pour moi. Il s'agit dans les deux cas (modèle de Cox et régression logistique) de maximiser une vraisemblance par remontée de gradient. La seule chose qui diffère entre les deux est la manière dont est écrite la vraisemblance à maximiser. C'est cela ? Le problème est le même selon moi, sauf s'il y a des données censurées dans l'analyse de survie, ce qui conduit à une ré-écriture de la-dite vraisemblance, mais ceci se trouve dans tous les ouvrages (et sites web) qui traitent de l'analyse de survie.

Ai-je bien compris la question ?

HTH, Eric.
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Re: Cox proportional Hazard model et newton-raphson

Message par joyeux_lapin13 le Mar 6 Déc 2016 - 10:53

Salut Eric,

En effet, je viens de trouver ma réponse ici: https://courses.nus.edu.sg/course/stacar/internet/st3242/handouts/notes3.pdf . L'auteur y déroule même un exemple dont les résultats sont confirmés lorsque je fais tourner le package survival sous R.

Pour appuyer ce que vous m'avez écrit, en effet l'algorithme de Newton-Raphson ne change pas mais la vraisemblance et ses dérivées doivent être adaptées en fonction du modèle (logistique, Cox, etc).

De toute manière à chaque fois que je poste une com' je trouve la réponse 5 minutes après même si ça fait 1 mois que je galère dessus, déprimant lol.

Merci pour votre intérêt à mon topic.

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