Analyse coxph

Aller en bas

Analyse coxph Empty Analyse coxph

Message par yuyu2000 le Sam 23 Juil 2016 - 12:17

Bonjour
j'écris car j'ai un petit probleme en analysant des données de survie avec le package "survival" et la fonction "coxph".
J'étudie l'influence d'une maladie (NASH) sur la récidive d'un cancer et j'obtiens le résultat suivant :
Code:

          coef exp(coef) se(coef)      z Pr(>|z|)  
NASHYes -1.8370    0.1593   1.0082 -1.822   0.0684 .
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

       exp(coef) exp(-coef) lower .95 upper .95
NASHYes    0.1593      6.278   0.02208     1.149

Concordance= 0.539  (se = 0.019 )
Rsquare= 0.031   (max possible= 0.951 )
Likelihood ratio test= 6.45  on 1 df,   p=0.01107
Wald test            = 3.32  on 1 df,   p=0.06845
Score (logrank) test = 4.36  on 1 df,   p=0.03669

Je ne comprend pas comment je peux avoir une p-value en log-rank qui sort significative (0.036) alors que 1 est compris dans l'intervalle de confiance??
Help ! Wink


Dernière édition par A.D. le Mar 26 Juil 2016 - 16:06, édité 1 fois (Raison : Ajout des balises "code")

yuyu2000

Nombre de messages : 9
Date d'inscription : 07/07/2015

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Analyse coxph Empty Re: Analyse coxph

Message par Eric Wajnberg le Sam 23 Juil 2016 - 21:35

L'explication la plus probable est que vous utilisez deux procédures différentes pour tester la même hypothèse. L'une est construite sur l'intervalle de confiance qui est juste le paramètre estimée pour ou moins 1.96 son erreur standard. C'est une approximation asymptotique qui n'est pas très puissante.

En revanche un test de rapport de vraisemblance (ou ici un log-rank puisque vous comparez juste deux courbes de survie) est bien plus puissant et plus adapté. C'est le test qu'il faut "croire", sans l'ombre d'un doute.

HTH, Eric.
Eric Wajnberg
Eric Wajnberg

Nombre de messages : 1059
Date d'inscription : 14/09/2012

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Revenir en haut


 
Permission de ce forum:
Vous ne pouvez pas répondre aux sujets dans ce forum