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Message par Leelouh le Ven 17 Juin 2016 - 14:16

Bonjour bonjour !

Alors voilà, je suis en bioinformatique et je tests des outils, cela étant, j'aimerais pouvoir calculer la spécificité et la sensibilité.
Sauf que voilà, avant ça, j'ai quelques questions... !
Qu'est-ce que la sensibilité ? Et la spécificité ?
La sensibilité concerne-t-elle la capacité à détecter les vrais négatifs ?
La spécificité les vrais positifs ?

Ensuite, j'aurai également besoin d'aide pour calculer.
En effet, j'ai a : le nombre connu de variation, b : le nombre de variations détectées et c : le nombre de variations détectées faisant aussi parties de la liste des variations connues.

Merci de votre aide,
Leelouh.

Leelouh

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Message par joyeux_lapin13 le Lun 20 Juin 2016 - 11:57

Salut,

La spécificité c'est la capacité de ta règle décisionnel à prédire les sujets sains alors qu'ils sont réellement sains. La sensibilité c'est la même chose mais pour les sujets à risque. Bon ça c'est la notation française, à l'anglaise c'est l'inverse. Et si on veut se la jouer pédant on dira même qu'il s'agit de critères définis via une règle bayésienne (ouaaaaahhhhhh).

Ça se calcul très simplement, il faut juste croiser tes prédictions avec le statut réel (matrice de confusion) et en gros ta spécificité et ta sensibilité seront les éléments de ta diagonale.
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