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ACP

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Message par statisticienne le Jeu 19 Mai 2016 - 8:38

Bonjour,
Je suis en train d'effectuer une ACP,j'utilise la commande suivante:
Code:

res.pca = PCA(base, scale.unit=TRUE, ncp=5, quali.sup=c(1:8), graph=T)
Mais on m'affiche que les variables de l'ACP:il ne m'affiche pas les variables qualitatives supplémentaires en bleu comme d'habitude.
Ou est le problème ??
Merci!

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Message par Florent Aubry le Jeu 19 Mai 2016 - 13:02

Le variables qualitatives supplémentaires sont affichées sur la graphe des individus ; par défaut c'est leur barycentre et on peut y ajouter des ellipses de confiance. Ce sont las variables quantitatives supplémentaires qui sont affichées par défaut en bleu sur le cercle de corrélation avec les variables quantitatives actives.

Florent Aubry

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Message par statisticienne le Jeu 19 Mai 2016 - 13:14

Merci pour votre réponse,mais même sur la graphe des individus je ne les trouve pas!

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Message par statisticienne le Jeu 19 Mai 2016 - 13:15

ACP Captur11

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Message par statisticienne le Jeu 19 Mai 2016 - 13:17

ACP Acp10

pad de variables sup Sad

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Message par droopy le Jeu 19 Mai 2016 - 13:34

bonjour,

quand tu as ce genre de demande il est nécessaire que tu précises avec quel package tu travailles. A priori ici je dirais FactoMineR et factoextra ?
Si oui dans FactoMineR, de base il t'affiche les variable supplémentaires sur le graph des individus. Avec factoextra il te faut utiliser la fonction fviz_pca_ind et spécifier avec l'argument habillage quelle variable qualitative supplémentaire tu veux représenter, encore une fois dans l'espace des individus et non des variables.
Code:
fviz_pca_ind(res.pca, habillage = 4)
cdlt
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Message par Florent Aubry le Jeu 19 Mai 2016 - 13:34

Je suppose que le graphe des individus a été tracé par le package ggbiplot.

Les barycentres sont difficilement visibles mais ils correspondent aux points ayant le même motif que les symboles sous 'Groups'

Note importante à tous les demandeurs d'aide : Ne jamais oublier d'indiquer les packages et les fonctions utilisées.

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Message par statisticienne le Jeu 19 Mai 2016 - 13:44

Ok désolée,en fait j'ai utilisé le package factoextra.Par contre je n'ai pas bien saisie votre réponse. En fait mon but est de savoir il y a t il de colinéarité entre les variables quali et quanti. Parce qu'en fait je fais une régression ordinale,quand je n'utilise pas les variables quali dans le modèle je trouve que les variables quanti sont significatives.Alors que lorsque je les introduit je ne trouve plus de significativité des variables quanti. Je veux savoir est ce que je peux éliminer les variables quali de mon modèles s'il y a colinéarité entre elles et les variables quanti. Et dans mon cas est ce qu'il y a colinéarité.
Merci.

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Message par droopy le Jeu 19 Mai 2016 - 14:51

tu ne pourras pas voir ça avec ton ACP. Essaie l'analyse de Hill & Smith du package ade4 ou encore l'AFM.
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Message par statisticienne le Jeu 19 Mai 2016 - 14:53

ces outils servent à détecter la colinéarité entre variables?et s'il y a colinéarité je peux éliminer des variables dans ma régression?

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Message par droopy le Ven 20 Mai 2016 - 8:09

Pour ce qui est de la colinéarité tu peux regarder du du variance inflation factor (VIF) et sa version généralisée (GVIF).
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