Moyenne de deux analyses en triplicata

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Moyenne de deux analyses en triplicata

Message par Imso le Mar 15 Sep 2015 - 8:31

Bonjour,

Je traite des données sur excel pour mon projet de recherche.

Je réalise deux expériences similaires, mesurant la même donnée, en triplicata. La seule différence est que la population change entre les deux expériences.

J'ai mes résultats sous cette forme:

Expérience a:
(1) 15/48
(2) 34/87
(3) 38/54


Expérience b:
(1) 21/68
(2) 7/22
(3) 34/72


Comment dois-je estimer la moyenne et l'écart type de ces données ? Avant je regroupais mon triplicata en une seule fraction (15+34+38)/(48+87+54) et (21+7+34)/(68+22+72) et je faisait la moyenne en considérant que j'avais deux analyses simples, mais cela me donne un écart type élevé. J'aimerais traiter mes données différemment de façon à réduire mon écart type qui est sensé est plus faible étant donné que je réalise 6 mesures !

(PS: ces valeurs ne sont qu'a titre d'exemple Wink )

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Re: Moyenne de deux analyses en triplicata

Message par Eric Wajnberg le Mar 15 Sep 2015 - 11:39

Je commencerais par voir s'il y a une différence significative entre les deux expériences et au besoin entre les triplicatas dans chaque expérience. Si aucune différence ne se dégage alors, ou, je poolerais en effet.

Vous ne dites rien de ce à quoi correspondent les chiffres que vous données. Ca semble être des données de pourcentages (binomial). Une régression logistique pour faire les tests dont je parle semble être le choix qui s'impose.

Cordialement,

Eric.

Eric Wajnberg

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Re: Moyenne de deux analyses en triplicata

Message par Imso le Mar 15 Sep 2015 - 12:20

Merci pour votre aide Eric,

Oui en fait je compte des cellules au microscope et je mesure le pourcentage de viabilité avec un marqueur fluorescent.

Sur une même expérience c'est trois zones de comptages différentes avec la même population de cellules. Les résultats sont supposés être très similaires.

Une deuxième expérience est réalisée avec la même procédure de comptage, avec les mêmes conditions de traitement, mais cependant les conditions physiologiques cellulaires peuvent varier à cause de certains paramètres de cultures non maitriséés.

Je pense que la bonne façon de faire c'est
Experience 1 : viabilité=X1% ecart type=Y1 (avec un écart type relativement faible)
et Experience 2 : viabilité=X2% ecart type=Y2

Puis faire la moyenne X1 et X2.


Mais ce qui m’embête dans cette méthode, c'est que l'écart type de mes triplicatas n'est pas utilisé et mes triplicatas deviennent des analyses simples (en poolant).

Cordialement,
Pierre

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Re: Moyenne de deux analyses en triplicata

Message par Eric Wajnberg le Mar 15 Sep 2015 - 13:56

Vos données suivent donc bien des lois binomiales. L'idée - comme vous dites - de faire la moyenne X1 & X2 n'est pas la bonne, ou - a minima - il faudrait alors faire la moyenne pondérée. Par exemple, si X1 était calculé sur 1/10 et X2 sur 200/1000. La moyenne de 0.1 et 0.2 (i.e., 0.15) ne serait évidement pas le bon moyen d'estimer la moyenne générale.

Encore une fois, je pense qu'il faudrait d'abord vérifier l'absence de différence significative entre les deux expériences avant de pooler ou non, et - encore une fois - une régression logistique ferait ça très bien.

Cordialement, Eric.

Eric Wajnberg

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Re: Moyenne de deux analyses en triplicata

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