Combien de dimensions pour une ACP

Bonjour,

Je réalise des ACP avec Rcmdr sur R. Mon problème est que je n'ai pas compris combien de dimensions je dois utiliser pour mes ACP, je laisse les 5 dimensions proposées par R mais ne suis pas sûre que c'est la méthode adaptée à mon test.

Comment savoir combien de dimensions utiliser pour mes ACP ?

Merci d'avance pour votre aide !

Marion

C'est peut être un peu tard pour une réponse mais voilà quand même :

En ACP tu explores le jeu de données donc à toi de voir jusqu'à quel point tu veux les explorer.
Les composantes sont classées de la plus importante à la moins importante (de celle qui explique le plus de variance à celle qui en explique le moins). L'histogramme des eigenvalues te permet de rapidement voir si tes premières composantes expliquent bien ton modèle et le point de cassure est un bon indicateur de la qualité du modèle.

Si l'effet que tu étudies est important dans ton jeu de données, généralement les 3 ou 4 premières composantes sont suffisantes mais n'hésites pas explorer plus pour peut découvrir d'autres effets non soupçonnés a priori.

Tu as également des critères qui peuvent aider à sélectionner le nombre d'axes :

le critère du coude
les axes dont la contribution est supérieure à la contribution moyenne
etc.

Niaboc