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Message par boubou le Jeu 22 Mai 2014 - 10:29

Bonjour,
Voici un bout de mon tableau :
mois decade saison temp pluie especes
FEV 2 hiver 6.79 22 tircis
FEV 2 hiver 6.79 22 vulcain
MAR 1 hiver 5.47 0 aurore
MAR 1 hiver 5.47 0 vulcain
MAR 2 hiver 9.12 2.4 petite_tortue
MAR 2 hiver 9.12 2.4 vulcain
MAR 3 print 11.2 8.5 aurore
MAR 3 print 11.2 8.5 melitee_plantain
MAR 3 print 11.2 8.5 tircis
MAR 3 print 11.2 8.5 vulcain
AV 1 print 13.8 1.8 aurore
AV 1 print 13.8 1.8 azure_nerpruns
AV 1 print 13.8 1.8 carte_geographique

J'aurais voulu savoir si c'était mieux de faire une ACP ou ACM avec ce type de tableau? pour savoir ce qui peut influencer l'arrivée des papillons suivant le mois, la saison, la température et la hauteur de pluie.
Oui je suis pommée en statistiques --'

boubou

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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 11:12

Bonjour
Ce que j'ai compris des analyses factorielles c'est quand on cherche à caracteriser des individus par des variables. genre tel groupe d'athelete sont plus fort en saut et perche contrairement à l'autre groupe ....
Mais quand vous dites influencer, je pense à expliquer: qu'est ce qui explique l'apparition de ces espece en tenant compte des saison, temps, mois.... Et là on pense plutot à faire une regression adaptée à ce type de donnée.

Donc si vous pouvez eclairez davantage sur le resultat que vous voulez obtenir...?

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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 11:18

Ah j'ai une autre idée.
Vous pouvez faire une ACP avec les variable quantitative (avec l'hypothese pour moi que c'est le nombre d'espece de cette ligne ) ensuite vous mettez en supplementaire les variables qualitatives et vous lisez parallelement le cercle de correlation et le graphe de la projection des individus pour dire que tel groupe d'espece est caracteriser par telles variables

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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par boubou le Ven 23 Mai 2014 - 11:24

Bonjour, merci de votre réponse Smile
et du coup j'ai changé mon tableau qui ressemble à ça maintenant:
mois_decade temp pluie Azure_Nerpruns Belle-Dame Carte_geo
JAN_1 4.92 31.4 0 0 0
JAN_2 7.86 11.2 0 0 0
JAN_3 2.48 5.8 0 0 0
FEV_1 7.01 5.8 0 0 0
FEV_2 6.79 22 0 0 0
FEV_3 7.59 16.9 0 0 0
MAR_1 5.47 0 0 0 0
MAR_2 9.12 2.4 0 0 0
MAR_3 11.2 8.5 0 0 0
AV_1 13.8 1.8 0 0 1
AV_2 12.13 0 8 0 0
AV_3 15.34 8.1 7 0 0
MAI_1 15.1 16.6 15 0 6

Et donc j'ai fait des ACP et donc j'ai le graphe des corrélations et les obs des différents ind pour voir si c'est corrélé à la température et la pluviométrie.
Il me reste à voir pour les habitats ^^



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Message par boubou le Ven 23 Mai 2014 - 11:26

mais petite question comment je pourrais faire pour faire l'ACP avec mes variables quantitatives et ajouter les qualitatives? c'est les mettre comme descriptives nan? comme la saison je ne vois pas comment faire :/

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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 11:39

en fait apres avoir fait on ACP avec les variables quantitatives, tu mets en supplementaire les variables qualitatives. sur SAS ya une option supplementary qui le permet, sur R je ne sais pas à quoi ça correspond dans pca ou dudi.pca.
regarde l'aide sur R avec ces fonctions pour voir

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Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 11:42


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Message par boubou le Ven 23 Mai 2014 - 11:54

oui j'ai vu mais je sais pas si c'est moi qui est vraiment nulle :/ mais je comprend pas grand chose et je ne vois pas comment faire...

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Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 12:24


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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 12:26

oupss pour ton cas: les saison et moi seront dans quali.supp si tavai des variable quantitatives qui etaient ecarté de l'analyse tu utiliserais quanti.supp

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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par boubou le Ven 23 Mai 2014 - 12:32

merci beaucoup le site est cool en effet. mais maintenant c'est de savoir comment je fais mon tableau car y a tellement de choses à mettre que du coup pas facile ou faut que je le fasse espèce par espèce :/ mais même pas j'aurais pas le même nombre de valeurs pour chaque colonne...

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Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 12:51

finalement je crois que l'AFD (analyse en facteur discriminante) est mieux, car avec cette methode tu caracterise des var quali avec d'autre variable.
Essaie de voir en ce sens.
j'ai essayé de voir avec un acp puis faire une CHA (classification), mais le tableau pour le transformer a mon niveau c'est compliquer.
finalement je me demande est ce qu'on a pas fait fausse route. Peut être aussi l'ACM serait mieux que et tu met en supplementaire les variables quantitatives. Et eventuellement faire une CHA (Classification hierarchique ascendante)
Désolée.
Bonne chance

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ACM ou ACP Empty Re: ACM ou ACP

Message par boubou le Ven 23 Mai 2014 - 12:53

houla mais moi je connais pas tout ça :/
mais bon je vais essayer de chercher encore Smile
merci beaucoup de ton aide en tout cas

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Message par melanine le Ven 23 Mai 2014 - 12:56

sur le net tu trouvera des cours simple sur cela.
pas de quoi

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Message par zezima le Ven 23 Mai 2014 - 14:14

Petite précision : les .supp sont les variables qui apparaîtront dans les graphiques mais qui n'auront pas d'impact sur la variabilité des axes. C'est comme si tu mettais ces variables de côté lors de ton analyse.

Plusieurs vidéos sont disponibles sur youtube, tapes "François Husson" Smile

(il propose aussi la FAMD qui comprend tout type de variables)
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