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co-inertie

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Message par docteur en biologie le Jeu 6 Mar 2014 - 9:34

Bonjour
J'ai fait la co-inertie sur R et j'ai obtenues la figure, sachant que j'ai fais le % de la totalité des variables avec un test de permutation et une probabilité p = 0,25 et 1000 répliquas ( RV14=RV.rtest(pca1$tab,pca4$tab,10000).je voulais avoir les variations due aux facteurs physico-chimiques et celle due aux facteurs biologiques en %.
Merci beaucoup

docteur en biologie

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Message par Nik le Jeu 6 Mar 2014 - 14:41

Bonjour,

Pourrais-tu être un peu plus précis ?
La co-inertie a été réalisée entre quels tableaux ?
Tu veux les variations de quoi ?

Cdlt

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Message par docteur en biologie le Ven 7 Mar 2014 - 8:48

Bonjour
La co-inertie est faite entre des variables biotiques (populations phytoplanctoniques) et variables abiotiques (sels nutritifs), je veux avoir le % du à la variation des paramètres abiotiques et le % du à la variation des paramètres biotiques et le % du à la co-variation des deux paramètres,
j'espère que ça soit clair.
Merci d'avance

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Message par docteur en biologie le Lun 31 Mar 2014 - 8:49

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Message par droopy le Lun 31 Mar 2014 - 8:54

Bonjour,

Ce que tu cherches ressemble plus à un partitionnement de variation après une RDA qu'à une coinertie et le coefficient RV. Une coinertie regarde un lien entre deux tableaux autrement dit tu ne fais pas d'hypothèse sur le fait qu'un tableau explique l'autre, tout comme avec une corrélation. Si tu cherches à expliquer un tableau par un autre alors cette analyse n'est pas adaptée. C'est un peu la même différence entre une corrélation et une régression linéaire. Dans un cas tu cherches à mesurer la force d'un lien entre deux variables alors que dans l'autre cas tu cherches à expliquer une variable par une autre.

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