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Message par FMarwen le Mar 9 Juil 2013 - 10:00

Bonjour,

Je suis en train de lire document pdf sur Courbe de Roc sur ce lien :

le problème que j'arrive pas à comprendre l'objet
Code:
ndata$LTpred
a la page 27 !
Est ce que quelqu'un peux me aider ?
Merci beaucoup d'avance.

FMarwen

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Message par Ayana le Mar 9 Juil 2013 - 11:31

Bonjour,

Dans le code, ndata$LTpred désigne la variable des prédictions, le plus souvent issue du modèle logistique. Dans cet exemple, les prédictions se trouvent dans une table appelée ndata

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Message par FMarwen le Mar 9 Juil 2013 - 11:41

autrement les LTpred sont les ajustements de modèles ?

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Message par Ayana le Mar 9 Juil 2013 - 11:47

Oui. Si tu utilises un modèle logistique voici le code :
Code:

modele<-glm(groupe~variable,data=tab,family=binomial)
PS<-fitted.values(modele)
tab$PS<-PS

pred <- prediction(tab$PS, tab$groupe)
Ayana
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Message par FMarwen le Mar 9 Juil 2013 - 12:00

Désolé je te dérange ,mais ça marche pas ,Voici mon code :
Code:
logit <- glm(L_T ~ HD + D13 + D_Re + Z, family=binomial(logit), data=MergeTestP1)
summary(logit)
ndata <- data.frame(HD=MergeTestP1$HD,D13=MergeTestP1$D13,D_Re=MergeTestP1$D_Re,Z=MergeTestP1$Z)
fix(ndata)
#Predicted Probabilities
ndata$predict<- predict(logit,ndata,type="response")
#Decision rule (theta = 0.7)
ndata$decision<- ifelse(ndata$predict > 0.2,"1","0")
#Add reference column
ndata$Ref <- MergeTestP1$L_T
#Confusion matrix
t <- table(ndata$Ref,ndata$decision)
t
sum(t)
#Accurracy, TPR,FPR
acc <- (t[1]+t[4]) / sum(t)
TPR <- t[1] / (t[1]+t[2])
FPR <- t[3] / (t[3]+t[4])
library(ROCR)
# Build a prediction object
ndata$fit<-fitted.values(logit)
preds <- prediction(ndata$fit,ndata$Ref)
#Compute the conf matrix for every value of theta
perf <- performance(preds,"TPR","FPR")
#Plot the ROC Curve
plot(perf,colorize=T)
#Compute AUC
> auc <- performance(preds,"auc")


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Message par Ayana le Mar 9 Juil 2013 - 12:49

Oulà! C'est à quel niveau que ça marche pas, et tu cherches à faire quoi?
Ayana
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Message par FMarwen le Mar 9 Juil 2013 - 12:56

Bon merci beaucoup @ Ayana Smile , j'ai trouvé le problème (il faut installer le package {base}),sur ce lien

Peux être utile pour les visiteurs de la page.

FMarwen

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Message par FMarwen le Mar 9 Juil 2013 - 13:37

questions de plus :
Est ce que possible de tracer deux courbe de Roc sur le même graphe ?
Merci beaucoup d'avance .

FMarwen

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