Les posteurs les plus actifs de la semaine
Aytan
Standardisation des données AFC Vote_lcapStandardisation des données AFC Voting_barStandardisation des données AFC Vote_rcap 
c@ssoulet
Standardisation des données AFC Vote_lcapStandardisation des données AFC Voting_barStandardisation des données AFC Vote_rcap 
Adddd
Standardisation des données AFC Vote_lcapStandardisation des données AFC Voting_barStandardisation des données AFC Vote_rcap 
Eric Wajnberg
Standardisation des données AFC Vote_lcapStandardisation des données AFC Voting_barStandardisation des données AFC Vote_rcap 
gg
Standardisation des données AFC Vote_lcapStandardisation des données AFC Voting_barStandardisation des données AFC Vote_rcap 


Standardisation des données AFC

Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Standardisation des données AFC

Message par zezima le Mar 30 Avr 2013 - 11:00

Bonjour,

J'ai sélectionné une cinquantaine de variables, je les ai factorisé.

Seulement, j'ai certaines variables qui présentent beaucoup de NA. (3/4 de NA).

Je me demandais si cela faussait beaucoup l'AFC ?

Dois-je :

-supprimer les lignes avec des NA dans toutes les variables ?
-supprimes les variables comportant un pourcentage trop élevé de NA ?
-ne rien toucher ?
-autre ?

Merci d'avance

(ps: la réponse n'est surement pas "ne rien toucher" car j'ai un message d'erreur lorsque je lance prof.ligne=t(apply(data,1,profil))
Erreur dans apply(as.numeric(genes), 1, profil) :
l'objet (list) ne peut être converti automatiquement en un type 'double')
zezima
zezima

Nombre de messages : 899
Date d'inscription : 26/02/2013

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par niaboc le Mar 30 Avr 2013 - 11:31

l'AFC se fait normalement sur un tableau de contingence = 2 variables?

es-tu sûr de vouloir faire une afc?
niaboc
niaboc

Nombre de messages : 969
Age : 32
Localisation : Paris
Date d'inscription : 05/05/2008

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par zezima le Mar 30 Avr 2013 - 14:56

C'est juste, ils me sortent le message d'erreur suivant lorsque j'essaye de toucher à mes données :

Erreur dans svd(X) : infinite or missing values in 'x'

Comment puis-faire sinon ?

Je n'y connais pas grand chose en ACP, AFC et ACM.
zezima
zezima

Nombre de messages : 899
Date d'inscription : 26/02/2013

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par niaboc le Mer 1 Mai 2013 - 5:51

Si tes variables sont toutes qualitatives, il faut aller chercher du côté de l'ACM.
Toutes quantitatives, c'est l'ACP.
niaboc
niaboc

Nombre de messages : 969
Age : 32
Localisation : Paris
Date d'inscription : 05/05/2008

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par zezima le Mer 1 Mai 2013 - 12:11

Je te remercie, c'est surement pour ça qu'aucun de mes codes ne marchait sous R clown

Afin de m'assurer que c'est bien une ACM et non une AFC que je dois réaliser, je vais te décrire mon tableau :

rownames var1 var2 var3 var4 var5 var6 ...
AC1 0 0 1 0 1 1
AC2 0 1 1 2 1 0
AC3 0 0 0 0 1 2
AC4 1 0 1 0 1 2
AC5 0 1 0 2 0 0

Je voudrais réaliser un dendrogramme, une courbe du pseudo-F ainsi qu'une courbe du R² afin de choisir mon nombre de classes.
Enfin je voudrais réaliser un graphique afin de voir quels échantillons appartiennent à quel groupe. (ex: vieux, rapide, femme - jeune, rapide, homme - etc...)

C'est bien une ACM ?
zezima
zezima

Nombre de messages : 899
Date d'inscription : 26/02/2013

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par niaboc le Jeu 2 Mai 2013 - 5:56

oui
ACM suivie d une CAH afin de regrouper les individus qui se ressemblent
niaboc
niaboc

Nombre de messages : 969
Age : 32
Localisation : Paris
Date d'inscription : 05/05/2008

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par zezima le Jeu 2 Mai 2013 - 13:03

Merci, je vais étudier ça de près Very Happy
zezima
zezima

Nombre de messages : 899
Date d'inscription : 26/02/2013

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Standardisation des données AFC Empty Re: Standardisation des données AFC

Message par Contenu sponsorisé


Contenu sponsorisé


Revenir en haut Aller en bas

Revenir en haut

- Sujets similaires

 
Permission de ce forum:
Vous ne pouvez pas répondre aux sujets dans ce forum